Bienvenue dans la collection HAL du LBAE
Le Laboratoire de Biotechnologies Agroalimentaire et Environnementale (LBAE) est une équipe d'accueil (EA 4565) de l'Université Paul Sabatier.
Situé sur le site d'Auch de l'IUT Paul Sabatier (environ 500 étudiants), les activités du LBAE concernent l'étude de systèmes microbiens complexes (SMC) d’intérêt biotechnologique dans le domaine environnemental, en particulier pour l’optimisation de processus d’épuration biologiques et pour la valorisation du carbone résiduaire (eau, déchets).
Les microorganismes présents au sein d’agrégats et de biofilms présentent une résistance accrue aux stress environnementaux, qu’ils soient physiques, chimiques ou biologiques. Cette aptitude est généralement attribuée aux substances extracellulaires polymériques (SEP) qui constituent la matrice de ces agrégats, et qui dépend des microorganismes, mais également des conditions environnementales.
L’étude de ces phénomènes est relativement récente à l’échelle internationale pour des bactéries ubiquitaires non pathogènes, ce pourquoi les travaux du laboratoire visent à:
- Comprendre et décrire la sécrétion de SEP d’agrégats modèles ou de souches pures (bactéries hétérotrophes, organismes autotrophes) en fonction des conditions nutritives (rapport C/N essentiellement) ou de la présence de micropolluants (éléments traces métalliques, nanoparticules de carbone)
- Comprendre les mécanismes biologiques impliqués dans cette sécrétion par des approches moléculaires (biologie moléculaire et protéomique) afin d’orienter les métabolismes vers la production de SEP permettant le recyclage de carbone résiduaire (eaux usées, biodéchets)
Dernières publications
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Maritxu Labadie, Frédéric Marchal, Nofel Merbahi, Elisabeth Girbal-Neuhauser, Catherine Fontagné-Faucher, et al.. Cell density and extracellular matrix composition mitigate bacterial biofilm sensitivity to UV-C LED irradiation. Applied Microbiology and Biotechnology, 2024, 108 (1), pp.286. ⟨10.1007/s00253-024-13123-4⟩. ⟨hal-04695202⟩
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Valérie Dossat-Letisse, Julie Foulon, Claire-Emmanuelle Marcato-Romain, Elisabeth Girbal-Neuhauser. Screening de communautés bactériennes issues de granules aérobies épuratifs. CNRIUT 2023 Saint Pierre - La Réunion, IUT de Saint Pierre, Jun 2023, Saint Pierre (La Réunion), La Réunion. ⟨hal-04326705⟩
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Abdo Bou-Sarkis, Etienne Paul, Elisabeth Girbal-Neuhauser, Nicolas Derlon, Yolaine Bessière. Detection of Gel-Forming Polymers via Calcium Crosslinking, Applied to the Screening of Extracellular Polymeric Substances Extracted from Biological Aggregates. Gels, 2023, 9 (2), pp.157. ⟨10.3390/gels9020157⟩. ⟨hal-04058865⟩