Collection HAL de PGTB

La Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux (PGTB) est une infrastructure technologique adossée à l’UMR BIOGECO ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique académique et aux acteurs industriels.

La PGTB fait partie de l’Infrastructure de Recherche INRAE Genomics, avec les plateformes GeT et CNRGV de Toulouse, Gentyane de Clermont-Ferrand et EPGV de d’Evry. La PGTB est par ailleurs membre du réseau France Génomique, qui regroupe les principales plateformes de génomique au niveau national. Elle est membre de la Fédération des Plateformes Labellisées de l’Université de Bordeaux et elle est labellisée Plateforme stratégique par l’INRAE (CNOC) et le GIS IBISA.

La PGTB développe et propose des services faisant appel à des technologies moyen et haut débit reposant sur le séquençage (séquençage de courts et longs fragments d’ADN, métagénomique ciblée, séquençage de génomes et de transcriptomes, métagénomique totale et métatranscriptomique, capture de gènes, …), la recherche et le génotypage de mutations (SNP, INDEL et microsatellites), la quantification de l’expression de gènes et l’analyse d’ADN environnemental, sensible ou ancien en laboratoire confiné.