La structure musicale d'un morceau de musique est un concept auquel il est fréquemment fait référence en musicologie, mais pour lequel il n'existe pas de définition communément admise. Ceci soulève un problème méthodologique lorsque l'on souhaite concevoir et évaluer un procédé d'inférence automatique de structure musicale mais aussi lorsqu'il s'agit de spécifier une procédure d'annotation manuelle permettant de produire de façon reproductible une description structurelle pour un morceau de musique. Cet article présente une approche dite de décomposition en blocs autonomes comparables, fondée sur des principes inspirés du structuralisme et de la linguistique, et fournissant une méthodologie d'analyse à partir de critères simples et basés sur l'expérience musicale de l'annotateur. Une évaluation préliminaire de la méthode proposée, appliquée à l'annotation auditive de 20 morceaux, a aboutit à une concordance entre annotateurs supérieure à 90 %, puis, ultimement, à une annotation consensuelle.