C. R. Lazzari, M. G. Lorenzo, P. Pelosi, M. Calvello, L. Ban et al., Exploiting triatomine behaviour: alternative perspectives for their control, Memórias Inst. Oswaldo Cruz, vol.104, pp.705-712, 2005.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00424995

, Mots-clés OBP, CSP, transcriptome, séquençage à haut débit, adaptation, hémophagie, vecteur de la maladie de Chagas Références bibliographiques

P. Taberlet, E. Coissac, F. Pompanon, C. Brochmann, E. Willerslev et al., Ironing out the wrinkles in the rare biosphere through improved OTU clustering, Philos. Trans. R Soc. Lond B Biol. Sci, vol.21, pp.5863-5870, 1935.

. Preussing, 223 spécimens ont été séquencés, représentant environ 50 espèces distribuées sur les six continents. Les identifications, toujours délicates dans ce genre du fait de la plasticité morphologique des thalles, Hewson, 1970), ont été vérifiées avant et après les analyses phylogénétiques. Les marqueurs chloroplastiques rps4 et trnL-F ont été utilisés, comme précédemment proposé dans la seule phylogénie de la famille incluant des Riccardia, 1956.

G. G. Hassel-de-menendez, H. J. Hewson, E. Jones, M. Preussing, S. Olsson et al., Certains clades représentant de grands ensembles bio-géographiques sont mis en évidence, comme les clades africains et sud-américains, très bien soutenus. La référence de l'origine géographique des spécimens a été optimisée sous Mesquite et l'hypothèse d'une origine néotropicale du genre est proposée. L'optimisation de nouveaux caractères morpho-anatomiques associée à un enrichissement de notre échantillonnage nous permettra de mieux appréhender les modèles évolutifs pour ce genre, L'analyse des deux marqueurs pris indépendamment ainsi que de leur combinaison a confirmé la monophylie du genre, mais pas celle des sous-genres ni des sections traditionnellement décrits (Hassel de Menendez, vol.70, pp.196-228, 1956.

. Mots-clés-phylogénie, A. Marchantiophyta, and U. Riccardia,

C. Reeb1, Nicolas Puillandre2

, Rue Cuvier, vol.57

, 2 Muséum National d'Histoire Naturelle, Département Systématique et Évolution, Rue Cuvier, vol.43

«. , Une révision du genre Riccardia pour l¯rique a été entreprise, s puyant sur une approche de taxonomie intégrative basée sur des caractères morphologiques et moléculaires. Plus de 500 séquences ont été générées à partir de 360 spécimens africains, représentant dix espèces décrites et cinq morphogroupes non décrits. L-N a été extrait, amplifié et séquencé pour 3 marqueurs chloroplastiques (matk, psba-trnH, trnL-F) et un marqueur nucléaire (ITS2), avec un succès variable selon les marqueurs. Les analyses phylogénétiques ont été réalisées pour chaque marqueur indépendamment et sur plusieurs combinaisons (e.g. psba-trnH+trnLF, ITS2 + les trois marqueurs chloroplastiques). Les premiers résultats montrent que (1) seule une espèce décrite est retrouvée dans les analyses moléculaires (R. compacta), (2) plusieurs espèces décrites sont dispersées dans plusieurs lignées moléculaires, Résumé La systématique du genre Riccardia (Embryophyta, Marchantiophyta, Aneuraceae) est réputée difficile, notamment à cause de la plasticité morphologique des thalles, qui rend délicate la définition de caractères fiables pour décrire et identifier les espèces. Comme l écrit E.W. Jones dans les années soixante

K. Hassel, S. R. Ekrem, T. Jones, E. Liu, Y. Yan et al., Restricted variation in plant barcoding markers limits identification in closely related bryophyte species, New insights of the evolution of the liverwort familiy Aneuracaea (Metzgeriales, Marchantiophyta), with emphasis on the genus Lobatiriccardia, vol.3, pp.1424-1240, 1956.

, Mots-clés Barcoding, bryophytes, hépatiques

, Rodolphe Rougerie(1) Mehrdad Hajibabaei(2) Shady Shokrala(2) Jeremy Dondeyne(3) Marlucia Martins(4)

A. Feijo, Yeimmy Andrea Cuellar Criollo, issue.5

. Ur633-zoologie-forestière and F. Orléans, Canada, issue.2

E. Museu-paraense and . Goeldi,

, Je présenterai ensuite l'exemple d'une étude écologique réalisée le long d'un gradient de déforestation en Amazonie, avec pour objets d'étude deux familles de papillons, les Saturniidae et les Sphingidae. Pour plus de 1,700 spécimens collectés, nous avons utilisé une approche de type métabarcoding par pyroséquençage (Roche-454) pour chacune des 54 fermes échantillonnées le long du transect. Ces résultats sont comparés à ceux obtenus par une identification morphologique des spécimens, et discutés à la lumière d'un contrôle des identifications par séquençage Sanger. Cette étude démontre le potentiel de l'utilisation des NGS dans une approche de la biodiversité de type métabarcoding pour des problématiques écologiques ou de biologie de la conservation. L'identification précise des espèces grâce à la librairie de référence permet, Résumé Les Lépidoptères sont l'un des ordres d'insectes les plus diversifiés avec plus de 160,000 espèces décrites. Cette diversité, leur abondance et leurs relations étroites avec leurs plantes-hôtes en font d'intéressants indicateurs écologiques. Malheureusement, l'expertise taxonomique rare et incomplète de ces insectes limite souvent leur étude à celle des papillons diurnes

. Mots-clés,

, Métabarcoding, codes-barres ADN, Lépidoptères, identification spécifique, écologie, déforestation, Amazonie Références bibliographiques

O. Comandini, M. Contu, A. C. Rinaldi-;-richard, F. , M. Selosse et al., Chlorophyllous and achlorophyllous specimens of Epipactis microphylla (Neottieae, Orchidaceae) are associated with ectomycorrhizal septomycetes, including truffles: Microbial Ecology, Mycorrhizal networks: Mechanisms, ecology and modelling, vol.16, pp.39-60, 2004.

, Mots-clés Tuber melanosporum, réseaux mycorhiziens, plantes compagnes, barcoding ITS