. Vers, . Nouvelle, . De-prévenir, and . De-soigner-?-avec-le-séquençage-du-génome-humain, En étudiant les principales maladies des sociétés modernes, on constate, d'une part, que dans ces pathologies il ne s'agit pas seulement de l'implication d'un pathogène mais d'un déséquilibre global de la relation hôte-microbe ; d'autre part, les gènes humains ne constituent souvent qu'un facteur de risque minime. La génétique expliquerait aujourd'hui au mieux entre 5 et 10 % des causes de ces maladies, même quand un grand nombre de gènes de prédisposition sont cumulés. En revanche, l'analyse des gènes du microbiote permet de corréler très efficacement ces maladies à la présence de certains gènes microbiens. En conséquence, il faut donc que la médecine et la nutrition reconnaissent et prennent en compte le fait que l'homme et son microbiote sont une symbiose essentielle au maintien de la santé et du bien-être. Ces changements commencent à s' opérer. Aujourd'hui, les scientifiques sont en train d'apporter au patient des aboutissements de la recherche qui vont changer la médecine de demain. Nous entrons dans une ère de savoirs nouveaux où les photographies métagénomiques de chaque individu vont engendrer des gigaoctets de données médicales pour obtenir des possibilités de diagnostic et de suivi beaucoup plus précis, des gènes de prédisposition aux maladies ont été identifiés

M. Incriminé, Aujourd'hui, les axes de recherche se concentrent sur l'influence du microbiote sur la transmission des agents pathogènes et la mise au point de tests diagnostiques performants. Le but ? Détecter efficacement les pathogènes présents et pouvoir modifier à l'avenir la composition du microbiote de la tique pour éliminer les agents responsables des maladies. Il faut savoir que près d'une trentaine de maladies recensées en Europe sont dues à des bactéries, des virus ou des parasites de la tique. Pour l'instant, seule la maladie de Lyme est diagnostiquée -des remèdes existent -mais beaucoup d'autres sont encore ignorées. Afin de sortir du schéma « une maladie/un pathogène », l'Inra recherche activement -notamment à travers le projet « Oh ! Ticks » qui a démarré en 2016 -toutes les corrélations entre ces différents intervenants avec le microbiote de la tique au sein de ce qu, Premier vecteur de maladies animales au monde devant les moustiques : les tiques s'affichent aujourd'hui à la « Une » des journaux. Ces acariens possèdent en effet la désagréable particularité de transmettre nombre de maladies aux animaux et surtout à l'homme, dont la borréliose ou maladie de Lyme

. Milliards-d'amis-intimes-/-l'autre and . Génome, Joël Doré / joel.dore@inra.fr -01 34 65 27 09 / unité Microbiologie de l'alimentation au service de la santé

M. Dusko,

L. Métagénomique-emmanuelle-le-chatelier-emmanuelle and . Lechatelier@inra, fr -01 34 65 21 05 / unité Inra Métagénopolis LES VIRUS : GARDIENS DE L'ÉQUILIBRE Marianne De Paepe / marianne

U. Thomas,

L. Bactérienne-du-porc-claire-rogel-gaillard and /. Claire,

U. Vers, /. Au-microbiote-fanny-calenge, and . Fanny,

S. Bien-nourrir, M. Gluten-;-microbiologie, and . Gilles, AMI OU ENNEMI ? Annick Bernalier-Donadille / annick

. Que, . De, and . De-protéines, François Blachier / francois.blachier@agroparistech.fr -01 44 08 86 75 / unité Physiologie de la nutrition et du comportement alimentaire

L. Villes, M. Des-champs-/-des-fibres-pour-contrer-les-allergies-stéphane-hazebrouck, and /. Stephane,

O. Christel,

L. Vaches, /. Usines-À-gaz-diego-morgavi, and . Diego, 57 / unité mixte de recherche sur les Herbivores

L. Probiotiques, D. Bactéries, . Nous, P. Du-bien, and . Langella,

P. Et and . Bovines, UNE PISTE À SUIVRE Sergine Even / sergine.even@ inra.fr -02 23 48 59 44 / unité Science et technologie du lait et de l'oeuf

L. Rabot and /. Sylvie,

U. Bactérie, . Pour, and . Le-stress, Vassilia Théodorou / vassilia.theodorou@inra.fr -05 82 06 63 41 / unité mixte de recherche Toxalim

R. Séparation-mère/nouveau-né, /. Stress-précoce-valérie-daugé, and . Valerie,

A. Microbiote-et, /. Doré, and . Joel,

C. Leterrier and /. Christine, 97 / unité Physiologie de la reproduction et des comportements (Inra, CNRS

L. Vie, Nicolas Meunier / nicolas.meunier@inra.fr -01 34 65 25 55 / unité Inra Neurobiologie de l'olfaction COMMENT, Joël Doré / joel

U. Le-nourrisson, C. Cherbuy, and /. Claire,

L. Mercier-bonin and /. Muriel,

A. Bousquet,

/. Olivier-zemb, . Olivier, and . Zemb@inra, fr -05 61 28 50 99 / unité Génétique physiologie et systèmes d'élevage

, fr -01 49 59 69 44 / Institut de recherche interdisciplinaire en sciences sociales PATHOLOGIES ET MICROBIOTE DIABÈTE, CIRRHOSE DU FOIE Hervé Blottière / herve, PROJET TRAJ Nicolas Fortané / nicolas.fortane@inra

S. Dusko, Ehrlich / stanislav.ehrlich@inra.fr -01 34 65 25 10 / unité Inra Métagénopolis MALADIES INFLAMMATOIRES DE L'INTESTIN Philippe Langella / philippe

P. Cancer, /. Lepage, and . Patricia,

C. Gérard,

M. De-disparition, P. Velge, and /. Philippe,

L. Vers, /. Doré, and . Joel,

S. Dusko, 10 / unité Inra Métagénopolis MALADIES DUES AUX TIQUES : LE MICROBIOTE INCRIMINÉ ? Muriel Vayssier-Taussat / mvayssier@vet-alfort.fr -01 43 96 71 51 / unité Biologie moléculaire et immunologie parasitaires et fongiques

. Glossaire,

, Archées / Les archées sont des micro-organismes unicellulaires procaryotes (sans noyau) qui ne sont pas considérées comme des bactéries

, Axénique / Des animaux axéniques sont indemnes de tout micro-organisme et donc exempts de microbiote, Ces animaux exigent des conditions de laboratoire très strictes et des installations stériles très spécifiques

, Commensales / Les bactéries commensales vivent pacifiquement dans notre organisme qu'elles colonisent sans provoquer de maladie

, Coprophagie / La coprophagie est le nom donné au comportement de l'animal

, Epithélium intestinal / L'épithélium intestinal est la couche de cellules qui recouvre les villosités de l'intérieur de l'intestin et qui fait la liaison entre l'intérieur de l

, Insulino-résistance / L'insulino-résistance est définie par une réduction de la réponse biologique à l'action de l'insuline (qui vise à diminuer le taux de glucose dans le sang)

, Métagénomique / La métagénomique consiste à étudier collectivement les gènes d'une communauté microbienne dans son ensemble (bactéries, virus, champignons, archées...), sans exiger l'accès aux microbes isolés par culture au laboratoire. On analyse et modélise la diversité et la composition de communautés complexes par séquençage haut débit de leur ADN

/. Metahit and . Metahit, e PCRD), coordonné par l'Inra, qui s'est terminé en juin 2012 et a rassemblé au sein d'un consortium international 14 organismes de recherche et industriels européens, METAgenomics of the Human Intestinal Tract) est un programme de recherche européen

, Potentiel redox / Le potentiel redox (ou potentiel d'oxydo-réduction)

, Prébiotique / Un prébiotique est constitué de fibres alimentaires qui stimulent sélectivement la croissance et/ou l'activité de bactéries intestinales et est potentiellement associé à la santé

, Probiotique / Selon la définition officielle de l'Organisation mondiale de la santé, les probiotiques sont des micro-organismes (bactéries ou levures), qui ingérés en quantité régulière et de façon adéquate, peuvent avoir des effets bénéfiques pour notre santé au-delà de leurs valeurs nutritionnelles, On les trouve principalement dans les produits laitiers fermentés et dans certains compléments alimentaires

, Réseau trophique / C'est l'ensemble des relations alimentaires entre organismes, micro-organismes ; par lesquelles l'énergie et la matière circulent

, Transplantation fécale, greffe fécale ou transfert de microbiote fécal / Il est possible de modifier le microbiote intestinal via des recommandations nutritionnelles ou grâce aux probiotiques

, Conception et réalisation : Studio graphique -Inra-UCPC / Photo de couverture : © Fotolia Janvier, 2017.