La mise en application de la DCE dans le contexte français nécessite la réalisation d'une phase de diagnose initiale de l'état écologique des hydrosystèmes, au cours de laquelle chaque District Hydrographique doit faire, en ce qui concerne sa zone géographique d'attribution de compétence, l'inventaire : 1) des hydrosystèmes actuellement en bon état écologique, et 2) de ceux actuellement situés en-dessous de cette exigence minimale de qualité. L'état de la première catégorie d'écosystèmes aquatiques devra être préservé à échéance de 2015 (absence de dégradation additionnelle), des mesures de gestion corrective devront être mises en place pour les deuxièmes. Dans tous les cas, une méthodologie de contrôle permettant d'évaluer la tendance d'évolution doit être mise au point, afin de vérifier que ces hydrosystèmes atteignent le « bon état écologique » à l'échéance précitée. Ce document décrit les résultats obtenus, dans l'état actuel d'adéquation imparfaite des jeux de données existants avec le but poursuivi, afin de proposer pour l'IPS et l'IBD des valeurs limites du « Bon Etat » par HER1 sur le territoire national.