Conscients de l'enjeu majeur que représente l'eau tant pour le développement local que pour la construction européenne dans le prolongement de la directive cadre sur l'eau adoptée en 2000, les directeurs généraux de l'INRA et du Cemagref ont décidé d'engager une réflexion prospective sur l'eau et ont confié cette action à un groupe de projet commun aux deux organismes. Cette prospective Eau et milieux aquatiques est notamment destinée à donner aux deux organismes les éléments d'orientation pour leurs politique de recherche et fournir aux différents acteurs, politiques, administratifs, économiques et scientifiques, des éléments de réflexion pour leurs choix stratégiques. Elle concerne l'Europe et le Bassin méditerranéen à l'horizon 20020-20025.