Les activités anthropogéniques responsables en grande partie de la contamination métallique des écosystèmes fluviaux. Les métaux sont des contaminants persistants et bioaccumulables aux nombreux effets délétères sur le biota. De ce contexte, le but principal de cette étude était d'évaluer la toxicité de métaux dans les cours d'eau Riou Mort (France, Zn et Cd) et Osor (Espagne, Zn) en analysant différents paramètres de fluorescence de la Chl-a en complément de la composition diatomique des communautés périphytiques naturelles. Deux expériences indépendantes ont été effectuées, basées sur la translocation de biofilms matures développés en conditions non contaminées (amont du cours d'eau) vers l'aval (2 sites aval sur le Riou-Mort, 5 le long de la Riera d'Osor). Après transfert des biofilms (6, 24, 72h) de l'emplacement non pollué aux sites contaminés, les paramètres de fluorescence ont été suivis au PhytoPAM. Les effets à long terme sur la communauté ont également été étudiés, avec une détermination des paramètres photosynthétiques et de la structure de la communauté diatomique après 1, 3 et 5 semaines d'exposition. Le plan d'expérience appliqué, employant des translocations de biofilm, semble être une bonne approche pour l'évaluation in situ des effets aigus et chroniques des métaux sur le biofilm.