Ce document vise à proposer un cadre pour l'échantillonnage, la conservation, l'observation et le dénombrement des communautés phytoplanctoniques dans le cadre de la mise en ½uvre de la Directive Cadre sur l'Eau (DCE) et un cadre d'acquisition des éléments physico-chimiques obligatoirement associés. Il est le résultat des expériences acquises au cours des 500 relevés de phytoplancton réalisés sur plus de cent lacs du territoire français stockés dans la base Plan d'eau du Cemagref obtenus pour partie dans le cadre de relevés types « Diagnose Rapide » (Cemagref, 2003) ainsi que de l'intégration des exigences de la DCE et de la norme européenne NF EN 15204 (2006). Ce protocole s'applique à l'ensemble des plans d'eau français qu'ils soient profonds ou de faibles profondeurs, stratifiés ou non. Une uniformisation de la collecte des données est indispensable afin d'assurer la bancarisation des informations sur le phytoplancton dans le cadre de la mise en ½uvre de la DCE sur les plans d'eau et la mise en place des Réseaux de Contrôle et de Surveillance (RCS) et de Référence (RR). Une base de données cohérente à l'échelon national contenant des données comparables est également indispensable pour être en mesure de faire évoluer l'indice planctonique de la Diagnose Rapide et le rendre « DCE compatible ». Ce travail est le fruit de la collaboration entre l'unité de Recherche Réseaux, Epuration et Qualité des Eaux du Cemagref de Bordeaux et l'INRA de Thonon-les-Bains à laquelle s'est ajoutée la contribution de Maria Leitao du bureau d'étude Bi-Eau.