Une nouvelle version de l'IBD a été normalisée en 2007, et une des grandes différences par rapport à la version initiale est la prise en compte pour son calcul d'un nombre accru de taxons clés. De plus, le concept de taxons appariés, regroupant sous la même dénomination des espèces morphologiquement proches, a disparu. Un nouveau guide iconographique, plus complet que l'ancien, doit donc être mis à disposition des utilisateurs. A l'heure actuelle une première version a été réalisée par le Cemagref, et soumise aux experts Diren qui ont d'ores et déjà inscrit sa révision au programme de leurs journées techniques. 55 taxons appartenant à la liste des taxons clés ne pourront être illustrés mais leurs références bibliographiques précises seront fournies. 33 autres taxons sont en attente d'une illustration fiable. La «forme du guide » est ici présentée, mais l'objet de la présentation est aussi de discuter ensemble de la philosophie taxonomique qui doit être adoptée. Certains groupes complexes font l'objet de débats, mais un choix, certes arbitraire, doit être fait afin d'assurer une méthode de détermination homogène entre tous les opérateurs. Ce choix s'inspirera certainement des travaux européens actuels dans le cadre de l'intercalibation des méthodes diatomiques de bio-indication : un groupe de 8 experts (dont le Cemagref) travaille à l'adoption de dénominations identiques entre pays participants, concernant notamment les complexes taxonomiques suivants : Achnanthidium minutissimum, Fragilaria capucina,Nitzschia palea, Gomphonema parvulum, Gomphonema pumilum, Cocconeis placentula, Navicula seminulum/Navicula minima.