La Directive Cadre sur l'Eau impose de quantifier l'état écologique des masses d'eau par rapport à un état de référence, qui correspondrait à un état vierge. En France, aucune masse d'eau ne peut-être considérée dans un état vierge, et aucune donnée historique ne permet de caractériser cet état, c'est pourquoi il est nécessaire de le modéliser. Pour cela, l'utilisation d'arbres de classification et de régression a été envisagée et a fourni des premiers résultats encourageants les années précédentes. Cette année, une méthode à partir d'arbres de régressions multiples qui avait donné de bons résultats sur les lagunes, a été appliquée aux estuaires. Malheureusement, cette méthode n'a pas permis de fournir de prédiction pertinente pour les estuaires, du fait d'une trop forte hétérogénéité de ces masses d'eau. Des arbres de régression boostés ont également été proposés pour prédire la présence/absence de guildes de poissons. Ces arbres, contrairement aux arbres de régression et de classification traditionnels, sont conçus explicitement pour la prédiction et pourraient donc constituer des outils pertinents pour la prédiction d'un état de référence. Une première analyse sur les poissons d'eau douce donne des résultats satisfaisants, en revanche, la méthode souffre de faiblesses en extrapolation qui risque de limiter les possibilités d'utilisation. Une troisième approche basée sur la construction d'une typologie des lagunes méditerranéennes à partir de la structure de l'assemblage ichtyofaunistique a été proposée. Cette approche a permis de mettre en évidence des disparités fortes entre lagunes. Une corrélation avec les caractéristiques physiques des masses d'eau et avec les seuils de tolérance physico-chimiques définis pour les espèces utilisées dans la classification devrait permettre de mieux comprendre les facteurs influençant la typologie des lagunes, et éventuellement d'améliorer la définition des états de référence.