Use of pattern trees for the study of relationships between ecological and biological traits and environmental parameters
Utilisation des Pattern Trees pour l’étude des relations entre traits écologiques et biologiques et paramètres environnementaux
Résumé
Le travail réalisé dans le cadre de la convention Onema-Cemagref 2010 sur la pertinence des traits écologiques et biologiques comme descripteurs synthétiques des communautés de diatomées, avait permis d’après étude bibliographique de déterminer une liste de traits candidats dans la perspective de la mise en oeuvre d’un indice multimétrique. A l’issue d’un rapide et simple test de ces métriques s’était imposée la nécessité d’entamer un travail d’investigation sur les relations entre ces traits et les conditions du milieu, à partir : - d’une base de données conséquente, - et avec l’aide de techniques biomathématiques performantes permettant de relier paramètres environnementaux et traits dans une logique de type pression/impact. Ce sont les résultats de ce travail que nous reportons dans le présent document. Le modèle mathématique utilisé est une technique récente appelée « pattern trees ». Nous attirons l’attention sur le fait qu’un important travail a été réalisé pour mener à bien cette étude (6 mois de CDD Ingénieur d’Etudes en biomathématiques ont été nécessaires) : bibliographie, codage, mises au point et création d’un package « R » spécifique. Ce document doit être considéré étant principalement d’ordre méthodologique, la méthode proposée et mise en oeuvre pouvant être transposée à tout maillon biologique.