Dans le cadre de la DCE et d'un partenariat entre l'INRA-CARRTEL, Thonon, et le Pôle Onema-Irstea, Aix-en-Provence, ce travail propose de répondre en synergie à des questions communes d'efficacité des réseaux de surveillance des grands lacs par le biais d'une modélisation franco-suisse en collaboration avec EDF, l'EPFL (Lausanne) et l'Université de Genève. En effet, l'évaluation de l'efficacité des protocoles de suivi des paramètres physico-chimiques des « Réseaux de Contrôle de Surveillance » (PC : température, oxygène dissous, transparence, phosphore total, orthophosphates, nitrates, nitrites, ammonium...) et du phytoplancton (PHYTO : abondance de Chlorophylle-a), et, par conséquent, l'évaluation de l'efficacité des outils d'évaluation de l'état écologique des plans d'eau, nécessite une connaissance des variabilités spatiale et temporelle des observations PC et PHYTO. La représentativité du protocole actuel de suivi RCS, mis en place en 2005, a donc été évaluée, comme préconisé dans les guidances européennes pour la mise en application de la DCE, afin de permettre à terme les justes évaluations de l'état écologique des plans d'eau dans leur globalité ainsi que la mise en place de programmes de mesures efficaces et durables. Pour évaluer la représentativité temporelle des données ponctuelles des réseaux de suivi, les données de suivis de type suivi scientifique (e.g. réseau SOERE GLACPE : Grands Lacs Périalpins) ou de type suivi RCS densifié à l'initiative de certaines agences de bassins (e.g. retenues de Villerest 42 et de Naussac 48) ont été analysés. Pour évaluer la représentativité spatiale (horizontale et verticale), l'analyse des résultats de modélisation tridimensionnelle des caractéristiques PC et PHYTO a été réalisée. Ce rapport présente les résultats de ces analyses.