La Directive Cadre Européenne sur l'Eau (DCE) exige la mise en oeuvre de suivis hydrobiologiques au sein des réseaux de surveillance afin d'évaluer l'état écologique des masses d'eau. Cette Directive a entraîné le développement et/ou l'adaptation de méthodes de bio-indication, qui doivent faire preuve d'un niveau de confiance et de précision suffisants. Dans le but d'évaluer ce niveau de confiance et de précision, un programme national ONEMA-AQUAREF a été lancé à partir de 2013, permettant de travailler sur les sources de variabilités et d'incertitudes liées à l'application des méthodes d'évaluation végétale de l'état écologique des cours d'eau, notamment sur les maillons biologiques des diatomées benthiques et des macrophytes des cours d'eau. La présente communication, réalisée dans le cadre du Groupe National Qualité des Eaux (GNQE) lors de sa réunion du 04-04-2017 à Paris, vise à effectuer une restitution de l'étude nationale conduite par Irstea Bordeaux de 2013 à 2016, dont l'objectif était d'estimer l'incertitude associée à l'évaluation diatomique des cours d'eau à partir de l'IBD2007. En effet, les intervenants des DREALs ont été largement mis à contribution pour la réalisation de cette étude, notamment pour la réalisation de 2 campagnes de prélèvements 2013 et 2014, ainsi que pour la détermination et le comptage d'une soixantaine d'échantillonnages diatomiques venant alimenter le volet d'étude de l'incertitude inter-opérateurs. Il avait été convenu de les informer spécifiquement des principaux résultats obtenus au cours de cette étude et d'amorcer une discussion scientifico-technique à ce sujet, ce qui est l'objet du présent exposé oral.