Flore Diatomées des Antilles Françaises : volume introductif + 5 volumes - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Ouvrage Année : 2017

Diatom Flora of the French West Indies: Introductory volume + 5 volumes

Flore Diatomées des Antilles Françaises : volume introductif + 5 volumes

Michel Coste
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1075419
A. Eulin Garrigue
  • Fonction : Coordinateur scientifique
E. Lefrançois

Résumé

As part of the obligation to implement the WFD in the French overseas territories, a Research and Development Program, aimed at setting up a new diatom index dedicated to the French West Indies watercourses ecological status assessment, has been initiated and financed by the Water Offices of Martinique and Guadeloupe, with the assistance of the Environment Ministry Services of Martinique and Guadeloupe, as well as the AFB (ex-ONEMA). The initial program, followed by a complementary program aimed at better describing certain specific biogeographical aspects previously poorly covered, was implemented by the Asconit - Irstea partnership consortium from 2009 to the end of 2014, which also contributed a share of self-financing. The work resulted in the development of a first version of IDA (Indice Diatomique Antilles) in 2013, which was replaced the following year by a new version (IDA2) supported by data from the complementary program and better adapted to certain local specificities. This new version of IDA served as a basis for the publication of the Evaluation Decree of 27-07-2015 which, among other regulatory aspects, formalized the new diatom-based assessment system for the West-Indian rivers. Various complementary achievements have supported the effective operational transfer of this new method, namely: 1) the online access to a simplified script for calculating the regionalized ecological status derived from IDA2 under software R, accompanied by its user's manual; 2) editing of an IDA methodological guide; 3) the production of an IDA taxonomic guide including 186 taxon sheets which summarize, for each of the species contributing to the calculation of this index, the different types of information (morphological, taxonomic bibliography, chorological and auto-ecological) available at the end of the program. However, out of a total of 547 different taxa that could be identified as such and counted in West-Indian inventories at the end of this research program, nearly 2/3, still too lowly present for calculation of their ecological preferences and their index profile, were not ultimately included in the IDA taxonomic guide. However, despite their relative rarity, it is important to identify them correctly in local assemblages. Indeed, under condition of sufficient information on their ecology by then, they can participate in the foundation of future versions of this index. It is therefore with the aim of summarizing, valuing and making public all this knowledge accumulated on the diatoms of the West-Indian rivers, that the elaboration of the present work has been decided. That flora, which constitutes a 6-volume-reference book for the West Indian diatom species, will be of great help to the future contributors who will have to determine the diatoms within the framework of the surveillance networks. Indeed, in addition to taxa probably endemic to the West Indies, which do not seem to have been described in the classical taxonomic bibliography (taxon name under number), this flora recapitulates in French, in a single and accessible book, a taxonomic information at the worldwide level, previously fragmented in a large number of scientific articles and books often published in the native language of the country of origin, some of these references being furthermore difficult to access. Finally, this flora contains information on the 186 IDA index taxa, but also on the other taxa found at lower numbers, but identified at the specie level on the stations of the surveillance network and the complementary networks put in place, as well as on certain special situations found in Martinique and Guadeloupe (hydrothermal springs, downstream of sewage plants, "Biological Reservoirs" inventory sites, downstream sites of watercourses under coastal haline influence, etc…). Last, the study of some samples taken in Dominica revealed a great convergence of local diatomic communities with the flora of the French West Indies, but to date, some taxa found here have not yet been observed in Guadeloupe or Martinique. They have been integrated into this flora in dedicated boards.
Dans le cadre de l'obligation de mise en application de la DCE dans les DOM, un programme de Recherche-Développement visant à mettre en place un indice diatomique pour l'évaluation d'état des cours d'eau des Antilles Françaises a été initié et financé par les Offices de l'Eau de Martinique et de Guadeloupe, avec le concours des DEAL de Martinique et de Guadeloupe, ainsi que de l'AFB (ex-ONEMA). La réalisation du programme initial, puis d'un programme complémentaire visant à mieux renseigner certains aspects biogéographiques spécifiques antérieurement mal couverts, a été prise en charge par le consortium partenarial Asconit - Irstea de 2009 à fin 2014, qui a aussi apporté une part d'autofinancement. Courant 2013, les travaux ont débouché sur la mise au point d'une première version d'IDA (Indice Diatomique des Antilles), qui a été remplacée dès l'année suivante par une nouvelle version (IDA2) confortée par les données du programme complémentaire et mieux adaptée à certaines particularités du contexte local. Cette nouvelle version d'IDA a servi de base à la publication de l'Arrêté Evaluation du 27-07-2015 qui, entre autres aspects réglementaires, a officialisé le nouveau dispositif d'évaluation diatomique des cours d'eau des Antilles. Diverses réalisations complémentaires sont venues appuyer le transfert opérationnel effectif de cette nouvelle méthode, à savoir : 1) la mise en ligne d'un script simplifié de calcul de l'état écologique régionalisé à partir de l'IDA2 sous logiciel R, accompagné de sa notice-utilisateur ; 2) l'édition d'un guide méthodologique IDA ; 3) la production d'un guide taxonomique IDA notamment constitué de 186 fiches-taxons qui récapitulent, pour chacune des espèces contributives au calcul de cet indice, les différents types d'informations (morphologiques, de bibliographie taxonomique, chorologiques et auto-écologiques) disponibles à l'issue du programme. Cependant, sur un total de 547 taxons différents ayant pu être identifiés en tant que tels et recensés dans les inventaires Antillais à l'issue de ce programme de recherche, près des 2/3, encore trop peu présents en occurrence et/ou en effectifs cumulés pour se voir calculer des préférences écologiques et un profil indiciel, n'ont pas été inclus au final dans le guide taxonomique IDA. Cependant, malgré leur relative rareté, il est important de les identifier correctement dans les assemblages locaux. En effet, sous réserve d'acquisition d'une information suffisante sur leur écologie d'ici là, ils pourront participer à l'assise des futures versions de cet indice. C'est donc dans le but de récapituler, de valoriser et de rendre publique toute cette connaissance accumulée sur les diatomées des cours d'eau des Antilles, que l'élaboration du présent ouvrage a été décidée. Cette flore en 6 volumes, qui constitue un recueil de référence pour déterminer la flore des cours d'eau des Antilles françaises, sera d'une aide précieuse aux futurs intervenants amenés à déterminer les diatomées dans le cadre des réseaux de surveillance. En effet, outre des taxons probablement endémiques aux Antilles qui ne semblent pas encore avoir été décrits dans la bibliographie taxonomique classique (taxons sous numéro), cette flore en Français récapitule dans un ouvrage unique et accessible une information taxonomique de portée mondiale, auparavant parcellisée dans un grand nombre d'articles scientifiques, d'ouvrages souvent été édités dans la langue du pays d'origine, certaines de ces références pouvant de plus se révéler difficiles d'accès. Au final, cette flore contient les informations sur les 186 taxons indiciels de l'IDA, mais aussi sur tous les autres taxons reconnus en tant que tels au niveau spécifique et trouvés à plus faibles effectifs sur les stations du réseau de surveillance et des réseaux complémentaires mis en place, ainsi que sur certaines situations spéciales de Martinique et de Guadeloupe (sources hydrothermales, stations à l'aval de STEPs, sites de l'étude d'inventaire « Réservoirs Biologiques », sites aval de cours d'eau subissant un certain niveau d'influence haline littorale etc…). Enfin, l'étude de quelques échantillons prélevés à la Dominique a révélé une grande convergence des communautés diatomiques locales avec la flore des Antilles françaises, mais quelques taxons qui y ont été trouvés n'ont encore été observés ni en Guadeloupe, ni en Martinique à ce jour. Ils ont donc été intégrés à cette flore dans des planches dédiées.
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Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-02607205 , version 1 (16-05-2020)

Identifiants

Citer

Juliette Tison-Rosebery, Michel Coste, François Delmas, A. Eulin Garrigue, E. Lefrançois. Flore Diatomées des Antilles Françaises : volume introductif + 5 volumes. Observatoire de l'Eau de la Martinique, pp.789, 2017. ⟨hal-02607205⟩

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