L’approche épidémiologique de la santé de l’abeille domestique Apis mellifera est encore récente et motivée depuis quinze ans par l’augmentation des mortalités de colonies. Elle est conditionnée par des spécificités liées à la filière apicole. Dans le domaine de la surveillance, les objectifs doivent être déterminés avec précision pour s’assurer de répondre à une finalité opérationnelle. Les cas sont souvent difficiles à définir et doivent tenir compte de l’unité épidémiologique considérée. La collecte des données se heurte souvent à la disponibilité et à la qualité des outils de mesure. Pour lever ces contraintes, un effort particulier est à porter sur la formation et l’organisation des acteurs. Dans le domaine de l’épidémiologie analytique, les études se confrontent à la difficulté du choix des facteurs de santé à prendre en considération, en raison notamment de l’implication combinée de ces facteurs dans les troubles de santé observés. Cette multiplicité des facteurs et la complexité des mécanismes de leurs impacts nécessitent d’avoir recours à de grandes tailles d’échantillon ce qui est difficile dans la pratique. De même, le développement de modèles prévisionnels se heurte à la difficulté d’estimer les paramètres de ces modèles. L’ensemble de ces difficultés pousse les acteurs à partager les référentiels qui permettraient de mutualiser les données collectées.