Chado controller: advanced annotation management with a community annotation system - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Bioinformatics Année : 2012

Chado controller: advanced annotation management with a community annotation system

Résumé

We developed a controller that is compliant with the Chado database schema, GBrowse and genome annotation-editing tools such as Artemis and Apollo. It enables the management of public and private data, monitors manual annotation ( with controlled vocabularies, structural and functional annotation controls) and stores versions of annotation for all modified features. The Chado controller uses PostgreSQL and Perl.
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Bioinformatics-2012-Guignon-1054-6_1.pdf (375.55 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
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Dates et versions

hal-02651830 , version 1 (29-05-2020)

Identifiants

Citer

Valention Guignon, Gaëtan Droc, Michael M. Alaux, Franc-Christophe Baurens, Olivier Garsmeur, et al.. Chado controller: advanced annotation management with a community annotation system. Bioinformatics, 2012, 28 (7), pp.1054-1056. ⟨10.1093/bioinformatics/bts046⟩. ⟨hal-02651830⟩
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