Modélisation de la niche écologique des fétuques à feuilles fines : quels apports pour la conservation et la valorisation des ressources génétiques ?
Résumé
Rational sampling of spontaneous diversity of forage and turf species requires an a priori knowledge of the range of environmental conditions suitable for these species. We introduce some concepts and methods for investigating the environmental range of species by statistical modelling of species ecological niche, and we suggest how such investigations could help in planning collection campaigns and in improving choice of core-collections. Statistical modelling of ecological niche of a species consists in building a function of environmental parameters predicting presence of the species from a calibration dataset including observed presence/absence or abundance records of the species and environmental data at observation sites. From the example of a collection of fine-leaved fescue taxa, we showed that spatial references and environmental data recorded in genetic resource collection campaigns can be relevant information for species niche modelling. Two methods for investigating the environmental distribution of species and for niche modelling based on presence/absence data are presented: the canonical correlation analysis and the logistic regression. Examples combining niche model and GIS software are given that may contribute to organize collection campaigns. We suggest that models predicting the probability of presence of species may be useful for the selection of core-collections. Such models may help in delineating geographically isolated areas of presence of species that should be sampled separately for selecting a core-collection. In each isolated area of presence, it is proposed to stratify accessions in clusters according to the predicted probability of presence of the species in collection sites, and to select accessions in each cluster. Methods proposed in this paper may be useful to improve collection and conservation of spontaneous diversity of many crop species and of wild species related to crop species.
La modélisation statistique de la niche écologique d’une espèce consiste à construire une fonction de paramètres environnementaux qui prédit la probabilité de présence de l’espèce à partir d’un jeu de données de calibration comprenant des données de présence/absence ou d’abondance de l’espèce et des valeurs de paramètres environnementaux aux sites d’observation. A partir de l’exemple d’une collection de fétuques à feuilles fines, nous montrons que les données de référencement spatial et les données environnementales rassemblées à l’occasion des campagnes de prospection de ressources génétiques peuvent constituer une information pertinente pour la modélisation de la niche écologique des espèces. Nous présentons deux méthodes qui permettent l’étude de la distribution environnementale des espèces et la modélisation de leur niche écologique à partir d’observations de présence/absence : l’analyse canonique des corrélations et la régression logistique. Nous suggérons des représentations spatiales, obtenues à l’aide de logiciel SIG, des patrons de distribution environnementale de la diversité prédits par les modèles statistiques qui devraient permettre de mieux piloter les campagnes de prospection de diversité spontanée. Nous indiquons également comment les modèles de niche prédisant la probabilité de présence des espèces pourraient contribuer à optimiser le choix de core-collections. Les méthodes présentées dans ce document pourraient offrir des avantages identiques pour d’autres espèces d’intérêt agronomique disposant d’un compartiment de diversité naturelle, ainsi que pour des espèces sauvages apparentées à certaines espèces domestiques
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
Loading...
