Les bases de données en biologie doivent permettre le stockage d’une quantité croissante d’informations dont la nature est hétérogène. Des entités parfois très différentes sont à représenter, ainsi que leurs relations. De plus, les techniques variées utilisées pour générer les données doivent être prises en compte. De ce fait, il existe un foisonnement de bases de données spécialisées, dont nous décrivons ici les principales, ainsi que leurs interrelations.