Le co-métabolisme hôte-microbiote est à l’origine d’un très grand nombre de molécules intégrées au sein d’axes métaboliques complexes. De nombreuses études se sont attachées à la caractérisation fonctionnelle spécifique de certaines de ces molécules (AGCC, BCAA, TMAO, etc.), mais les études envisageant plus globalement les relations métaboliques entre l’hôte et son microbiote intestinal restent rares. À ce titre, l’étude globale des métabolites endogènes et exogènes présents dans le plasma par métabolomique non ciblée semble prometteuse.