Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérie
Résumé
La Production A Haut-Débit De Données Biologiques De Nature Hétérogène Nécessite UneExploitation Et Une Intégration Particulières De Celles-Ci. Malgré Le Développement De Nombreuses Bio-Ontologies, L'organisation De Ces Données Dans Un Cadre Structuré Et Adaptatif Reste Perfectible. NousEmettons L'hypothèse Qu'une Approche Systémique Multi-Echelle De La Représentation Des ProcessusCellulaires Permettrait De Progresser Dans Cette Problématique. Pour Valider Cette Démarche, Nous AvonsConçu Une Modélisation Ontologique Des Processus Bactériens Nécessaires A L'expression Génique. LesRelations Entre Ces Processus Et Leurs Molécules Participantes Ou Leurs Sous-Processus Ainsi Que LeursModèles Ont Eté Formellement Décrites. Cette Description S'accompagne D'axiomes Et De RelationsSupplémentaires Sur Lesquels Un Raisonnement Automatique Est Effectué. La Représentation Des ProcessusRéalisée Permet Leur Mise En Relation Avec Leurs Modèles Et Paramètres Par Inférence. Parallèlement, LeRaisonnement Apporte De Nouvelles Informations Contextuelles De Séquentialité, Agrégation Ou Compétition.Notre Contribution S'appuie Sur Les Bio-Ontologies Existantes Pour Une Meilleure Interopérabilité
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