Les écosystèmes d’eau douce sont d’importants réservoirs de biodiversité très sensibles au changement global. Outre leur intérêt propre, les enjeux qui s’y rattachent sont multiples : importance pour le maintien de la biodiversité terrestre, services écologiques (régulation et épuration de l’eau et énergie renouvelable) et engagements réglementaires. Aux conventions internationales et directives européennes protégeant certains types d’espèces et d’habitats, s’ajoute la DCE qui demande le retour au bon état écologique de toutes les masses d’eau d’ici 2015. Le poisson est un des indicateurs de la qualité écologique selon la DCE. L’IPR (Indice Poisson Rivière) comme le futur indice poisson estuaire (IPE) est de fait un des indicateurs de la stratégie nationale pour la biodiversité. En France, de longues chroniques d’état écologique sont disponibles et de nouvelles sont mises en place dans la cadre de la DCE. Les mesures du retour au bon état écologique (maintien des régimes hydrologiques, renaturation des cours d’eau, réhabilitation et conservation des zones humides) devraient permettre aux hydrosystèmes de supporter les impacts du changement global. Néanmoins, il importe de pouvoir évaluer la capacité adaptative des espèces et de résilience des hydrosystèmes et aller au delà de la simple évaluation de l’impact du changement climatique souvent abordée dans les études. Ainsi, un certain nombre de verrous à lever ont été identifiés et traduits sous forme de recherches prioritaires : * L’Amélioration de la précision des modèles reliant températures eau/air et hydrologie/ thermie dans différents contextes géographiques et à des échelles spatiales pertinentes pour la gestion. Dans ce cadre, le lien entre hydrologie et hydroécologie restreint à quelques d’espèces et milieux emblématiques doit être étendu * Le développement des connaissances en écophysiologie par un couplage d’approches terrain/expérimentation en intégrant le contexte génétique. * L’amélioration des modèles d’évolution d’aire de répartition des espèces qui reposent pour l’instant sur des méthodes statistiques, en intégrant leurs réponses aux forçages environnementaux. * Le développement de modèles permettant de simuler les évolutions à l’échelle d’un bassin versant des dynamiques démographiques en intégrant le rôle de la fragmentation et des mesures de restauration de la connectivité sous différents scénarios climatique * L’élaboration d’indicateurs du bon état écologique plus proches des fonctions et recourant à des outils de modélisation intégrant les conditions climatiques dans l’évaluation de l’écart à l’état de référence * L’élaboration d’indicateurs de bon fonctionnement pour aller au-delà des objectifs actuels de la DCE focalisés sur le bon état écologique. Elle devrait permettre de mieux estimer les tendances d’évolution des systèmes, la qualité et l’évaluation économique des services rendus. Des situations prioritaires ont été identifiées. Elles concernent des études à engager / renforcer dans le domaine cognitif (approche systémique et fonctionnelle, diversité génétique) et sur le fonctionnement des zones humides, milieux très sensibles à l’impact du changement climatique et essentiels dans la continuité écologiques des hydrosystèmes.