Plus de 30 virus infectant Apis mellifera ont été décrits à ce jour. Parmi eux, cinq virus sont largement répandus dans les colonies d'abeilles du monde entier et contribuent à la perte de colonies, plus particulièrement le Deformed wing virus (DWV ; Olivier et Ribière, 2016). la plupart d'entre eux sont transmis par le vecteur Varroa destructor, mais ils peuvent aussi être transmis verticalement, c'est-à-dire de la reine et/ou des faux-bourdons à leur descendance. En apiculture, il existe une grande diversité de stratégies et de pratiques pour renouveler le cheptel. Les pratiques de conduite des colonies et en particulier le remplacement des reines (remérage), en influant sur la transmission horizontale et verticales des virus, peuvent avoir un impact sur les charges d virus dans les colonies. L'état de santé de colonies conduites suivant un remérage annuel a été comparé à celui de colonies remérant naturellement, sur 120 colonies réparties dans deux ruchers. Pour chacune des deux stratégies, deux origines génétiques d'abeilles mellifère ont été étudiées : une génétique sélectionnée par un éleveur de reine remérant régulièrement ses colonies et visant à obtenir des colonies avec une forte population au printemps, et une génétique issue d'un apiculteur dont les colonies sont laissées en remérage naturel et sont sélectionnées sur leur production de miel. l'état de santé des colonies (charges virales moyennes), la force des colonies (méthode ColEval), la charge parasitaire de V. destructor, et la production de miel ont été mesurées au printemps et à l'automne sur une durée de 3 ans. Nous avons observé un fort effet du rucher, de la saison et de V. destructor sur la charge virale de DWV dans les colonies. Le modèle de données expliquant les variations de la charge en DWV montre aussi un effet significatif de la génétique de l'abeille et des pratiques de renouvellement des reines. Sachant que le DWV présente plusieurs formes recombinantes avec le Varroa destructor virus 1 (VDV-1) et que leurs pouvoirs pathogènes peuvent être différents, nous avons caractérisé les souches virales présentes dans les colonies. Par ailleurs, nous testerons l'influence de l'état sanitaire des colonies (charges virales du Deformed wing virus (DWV), Sacbrood virus (SBV), Black queen cell virus (BQCV), Chronic bee paralysis virus (CBPV), Acute bee paralysis virus (ABPV, ou espèces proches (Israeli acute paralysis virus (IAPV)) sur la production de miel et la dynamique des colonies.