Depuis les années 2000, les chercheurs engagés dans une démarche d’innovation doivent répondre à des impératifs d’évaluation émanant de bailleurs de fonds, d’agences nationales de recherche et de développement, ou de la société civile. Afin de satisfaire cette demande, les chercheurs, dans le champ de l’agronomie, doivent mobiliser des méthodes et des outils leur permettant de rendre compte des effets de leurs propositions non seulement sur le plan agronomique, mais aussi sur les plans économique, social ou environnemental. Ce chapitre présente les différentes méthodes d’évaluation pouvant être mobilisées, ainsi que les arbitrages à effectuer afin de choisir l’approche la plus adaptée à l’innovation étudiée ainsi qu’aux questions posées par l’évaluation. Deux études de cas portant sur l’utilisation de méthodes d’évaluation de l’impact de la recherche, conduites dans le cadre des projets ImpresS et Impresa, sont présentées et discutées.