, Hydrolyse, Enzymes et Fermentation

A. Rammal, E. Perrin, B. Chabbert, I. Bertrand, A. Habrant et al., Evaluation of Lignocellulosic Biomass Degradation by Combining Mid-and Near-Infrared Spectra by the Outer Product and Selecting Discriminant Wavenumbers Using a Genetic Algorithm, Applied Spectroscopy, vol.69, issue.11, pp.1303-1312, 2015.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01269475

, Action PT5a

G. Bastien, G. Arnal, S. Bozonnet, S. Laguerre, F. Ferreira et al., Mining for hemicellulases in the fungus-growing termite Pseudacanthotermes militaris using functional metagenomics, Biotechnology for Biofuels, vol.6, p.78, 2013.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268110

, Action PT5c

G. Arnal, G. Bastien, N. Monties, A. Abot, V. A. Leberre et al., Investigating the Function of an Arabinan Utilization Locus Isolated from a Termite Gut Community, Applied and Environmental Microbiology, vol.81, issue.1, pp.31-39, 2015.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01269098

, Action PT5c

G. Arnal, G. Bastien, P. Alvira, S. Melgosa-vidal, M. Rydahl et al., High-throughput characterization of a subset of proteins isolated from microbiota belonging to the termite Pseudacanthotermes militaris, 2016.

, Action PT5c

H. Ravalason, S. Grisel, D. Chevret, A. Favel, J. Berrin et al., Fusarium verticillioides secretome as a source of auxiliary enzymes to enhance saccharification of wheat straw, Bioresource Technology, vol.114, pp.589-596, 2012.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01001109

C. Bennati-granier, S. Garajova, C. Champion, S. Grisel, M. Haon et al., Substrate specificity and regioselectivity of fungal AA9 lytic polysaccharide monooxygenases secreted by Podospora anserina, Biotechnology for Biofuels, vol.8, 2015.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01202474

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D. Poggi-parodi, F. Bidard, A. Pirayre, T. Portnoy, C. Blugeon et al., Kinetic transcriptome analysis reveals an essentially intact induction system in a cellulase hyper-producer Trichoderma reesei strain, Biotechnology for Biofuels, vol.7, 2014.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01112360

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M. Bey, J. G. Berrin, L. Poidevin, and J. C. Sigoillot, Heterologous expression of Pycnoporus cinnabarinus cellobiose dehydrogenase in Pichia pastoris and involvement in saccharification processes, Microbial Cell Factories, vol.10, p.113, 2011.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02646207

, Action PE1c

M. Bey, S. Zhou, L. Poidevin, B. Henrissat, P. M. Coutinho et al., Cello-Oligosaccharide Oxidation Reveals Differences between Two Lytic Polysaccharide Monooxygenases (Family GH61) from Podospora anserina, Applied and Environmental Microbiology, vol.79, issue.2, pp.488-496, 2013.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268047

, Action PE1c

E. Jourdier, F. Ben-chaabane, L. Poughon, C. Larroche, and F. Monot, Simple Kinetic Model of Cellulase Production by Trichoderma Reesei for Productivity or Yield Maximization, Chemical Engineering Transactions, vol.27, pp.313-318, 2012.

M. Couturier, A. Roussel, A. Rosengren, P. Leone, H. Stalbrand et al., Structural and Biochemical Analyses of Glycoside Hydrolase Families 5 and 26 beta-(1,4)-Mannanases from Podospora anserina Reveal Differences upon Mannooligosaccharide Catalysis, Journal of Biological Chemistry, vol.288, issue.20, pp.14624-14635, 2013.

, Action PE2a

M. Couturier and J. G. Berrin, The Saccharification Step : The Main Enzymatic Components, Lignocellulose Conversion. V. Faraco, pp.93-110, 2013.

, Action PE2a

E. Dondelinger, N. Aubry, F. Ben-chaabane, C. Cohen, J. Tayeb et al., Contrasted enzymatic cocktails reveal the importance of cellulases and hemicellulases activity ratios for the hydrolysis of cellulose in presence of xylans, Applied Microbiology and Biotechnology, 2016.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01338300

, Action H1e

J. Marc, D. Feria-gervasio, J. Mouret, and S. E. Guillouet, Impact of oleic acid as co-substrate of glucose on "short" and "long-term" Crabtree effect in Saccharomyces cerevisiae, Microbial Cell Factories, vol.12, p.83, 2013.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01268439

, Action F2c

J. Montheard, S. Garcier, E. Lombard, X. Cameleyre, S. Guillouet et al., Assessment of Candida shehatae viability by flow cytometry and fluorescent probes, Journal of Microbiological Methods, vol.91, issue.1, pp.8-13, 2012.
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C. Bideaux, J. Montheard, X. Cameleyre, C. Molina-jouve, and S. Alfenore, Metabolic flux analysis model for optimizing xylose conversion into ethanol by the natural C5-fermenting yeast Candida shehatae, Applied Microbiology and Biotechnology, vol.100, issue.3, pp.1489-1499, 2016.
URL : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01886370

, Action F5a

, Thèses Futurol soutenues ou prévues 2012

G. Bastien, Découverte de nouvelles enzymes de dégradation des polysaccharides végétaux par métagénomique fonctionnelle, Ecole Doctorale SEVAB. INSA. Toulouse, 2012.

M. Bey, Etude d'une CDH et de glycosyl hydrolases de la famille 61 : Implication dans les processus de dégradation des lignocelluloses. Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé, 2012.

G. Bocqueho, Risque, temps et adoption des cultures pérennes énergétiques : exemple du cas français, Ecole Doctorale ABIES. AgroParisTech. Paris, 2012.

M. Couturier, Nouvelles enzymes pour l'amélioration de l'hydrolyse des lignocelluloses : identification, étude structure-fonction et ingéniérie de deux mannanases fongiques. Ecole doctorale Sciences de la Vie et de la Santé, 2012.

E. Jourdier, Modélisation et optimisation de la production de cellulases par Trichoderma reesei pour les bioraffineries lignocellulosiques. Ecole Doctorale Sciences pour l'Ingénieur, 2012.

C. Lesur, Cultiver Miscanthus x giganteus en parcelles agricoles : du diagnostic agro-environnemental à la conception-évaluation ex ante de systèmes de culture à vocation énergétique, Ecole Doctorale ABIES. AgroParisTech, 2012.

B. Fradj and . Nosra, Analyse micro-économique spatialisée des enjeux environnementaux de l'introduction de productions agricoles à finalité énergétique, Ecole Doctorale ABIES. AgroParisTech. Paris, 2013.

K. Dufossé, Bilan environnemental des cultures lignocellulosiques pour la production de bioéthanol de 2ème génération, Ecole Doctorale ABIES. AgroParisTech. Paris, 2013.

, Action R2b

E. Malki and R. , Architecture génétique des caractères cibles pour la culture du peuplier en taillis à courte rotation, 2013.

J. Marc, Modulation par approches microbiologique et génétique de la synthèse d'acide acétique lors de la production d'éthanol sous métabolisme oxydo-réductif chez Saccharomyces cerevisiae, Ecole Doctorale SEVAB. INSA. Toulouse, 2013.

J. Montheard, Amélioration des connaissances de la physiologie de Candida shehatae pour une quantification des phénomènes biologiques et leur modélisation lors de la fermentation alcoolique des pentoses, Ecole Doctorale SEVAB. INSA. Toulouse, 2013.

G. Arnal, Discovery and characterization of biomass-degrading enzymes and enzyme systems in termite gut microbial ecosystems, Ecole Doctorale SEVAB. INSA. Toulouse, 2014.

S. Arnoult, Contribution à la définition d'idéotypes de miscanthus valorisables pour la production de bioéthanol 2ème génération et perspectives en sélection. Ecole Doctorale SMRE, 2014.

M. Huron, Modélisation cinétique de l'hydrolyse enzymatique de la biomasse lignocellulosique, 2014.

L. Martin, Modéliser l'insertion territoriale du Miscanthus x giganteus à partir des décisions des agriculteurs : une approche exploitant le modèle du raisonnement à partir de cas, 2014.

. Poggi-parodi, Une approche de biologie systémique pour développer des souches industrielles performantes de Trichoderma reesei, Action, vol.1, 2014.

F. Ferchaud, Etude des bilans d'eau, d'azote et de carbone dans des agrosystèmes dédiés à la production de biomasse en fonction des espèces et des pratiques culturales. Ecole doctorale ABIES, 2015.

C. Bennati-granier, Nouvelles enzymes fongiques pour l'amélioration de la dégradation de la biomasse lignocellulosique : Etude des « Lytic Polysaccharide Monooxygenases » (LPMOs), 2016.