La compréhension des systèmes urbains et les réflexions prospectives à leur sujet, qu'elles soient envisagées par intérêt pour les enjeux de leur “métabolisme” (flux d’énergie, d’eau, de déchets, etc.) ou pour ceux de leur évolution (modification des activités et des équipements du système), peuvent difficilement se concevoir sans recourir à des modèles décrivant précisément leurs structures et leurs fonctionnements. A partir de 1/ notre propre expérience de telles modélisations, à différentes échelles et dans des contextes très divers (île de Noirmoutier, ville de Montpellier, district rural de Mouthoumet, Pays de Thau, Lozère, Languedoc-Roussillon, village de Casamance…), et 2/ d'un certain nombre de travaux du même genre en cours partout dans le monde (déclinaisons du modèle MARKAL pour Genève, Turin, New York, Shanghaï...), nous tenterons de montrer ce qui semble aujourd’hui résolu sur le plan méthodologique (description de la dynamique des flux) et ce qui ne l’est pas (prospective et processus de décision relatifs à l’évolution urbaine).