L'article présente l'une des premières applications empiriques de la procédure de double bootstrap (Simar and Wilson, 2003) dans une estimation en deux étapes de l'influence de variables environnementales sur des scores non paramétriques d'efficacité technique. Cette procédure permet d'obtenir des estimations efficaces dans les régressions expliquant les scores d'efficacité, tout en produisant des écarts-type et des intervalles de confiance pour ces scores d'efficacité. La procédure est appliquée à des exploitations tchèques, séparées selon leur spécialisation de production (animale ou cultures) et selon leur forme légale (individuelle ou collective). Pour les deux spécialisations de production, les exploitations collectives présentent un score d'efficacité technique pure moyen supérieur à celui des exploitations individuelles, suggérant que les exploitations collectives ont des pratiques de gestion plus homogènes que les exploitations individuelles. Les résultats de la régression employant le double bootstrap diffèrent peu de ceux provenant d'une régression standard. Les exploitations individuelles semblent plus affectées par la taille (influence positive sur l'efficacité) et le stress financier (influence négative) que les exploitations collectives.