Description de la diversite genetique chez Brassica oleracea a l'aide de marqueurs isoenzymatiques et moleculaires - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 1994

Description of genetic diversity within Brassica oleracea using isoenzymatic and molecular markers.

Description de la diversite genetique chez Brassica oleracea a l'aide de marqueurs isoenzymatiques et moleculaires

Résumé

The aim of this work is to construct homogeneous genetic pools for the multiplication of a crop collection of Brassica oleracea. Two methods of analysis of genetic diversity were compared. For intra-population investigations, the isoenzymatic method is more efficient. However, for studying population structure, the information given by RAPD (randomly amplified DNA sequence) is better correlated with morphological and agronomical diversity and is less expensive. The suggested method involves testing for the presence or absence of about 100 RAPD markers in a sample of mixed DNA from 40 seeds. The appropriate structure for the collection can be determined from inter-population and inter-cultigroup distances estimated by this technique. The data allow the construction of phylogenetic trees by the PA UP software (phylogenetic analysis using parsimony).
Deux méthodes d’analyse de la diversité génétique sont comparées dans le but de constituer des pools génétiques homogènes en vue de la multiplication d’une collection de choux (Brassica oleracea). Il apparaît que la variabilité génétique intrapopulation est facilement accessible par la méthode isoenzymatique. Cependant, pour la structuration des populations, c’est la méthode RAPD (amplification aléatoire d’ADN) qui fournit les informations les mieux corrélées avec la diversité morpho-agronomique et pour un moindre coût. La méthode proposée repose sur l’analyse de la présence-absence d’une centaine de marqueurs RAPD par échantillon, lui-même constitué de l’ADN en mélange de 40 graines. L’estimation des distances inter-populations et inter-cultigroupes par cette technique rend plus aisée la structuration de la collection. Les données permettent la construction d’arbres phylogénétiques à l’aide du logiciel PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony).

Mots clés

Domaines

Génétique
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Dates et versions

hal-02852191 , version 1 (07-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02852191 , version 1
  • PRODINRA : 160555

Citer

E. Margale, Anne-Marie Chèvre, Régine Delourme, Y. Herve. Description de la diversite genetique chez Brassica oleracea a l'aide de marqueurs isoenzymatiques et moleculaires. Colloque BRG/INRA. Ressources génétiques animales et végétales. Méthodologies d'étude et de gestion, Sep 1993, Montpellier, France. ⟨hal-02852191⟩

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