L'évolution des virus à ARN : rôles de la sélection et de la dérive génétique
Résumé
Les virus à ARN, tout comme les rétrovirus et pararétrovirus, ont la capacité d'évoluer très rapidement, grâce à des taux de mutations élevés et des temps de génération très courts. Les erreurs de réplication du génome (mutations et recombinaisons « imparfaites ») sont la source d'une grande variabilité. Cependant, des pressions de sélection sculptent les populations virales dans leur diversité en agissant à tous les niveaux du cycle infectieux des virus : stratégies d'expression du génome, interactions avec l'hôte et le vecteur sont les principales cibles de la sélection. La sélection trie en fonction de la valeur adaptative. Le second paramètre important modulant la diversité des populations virales est la dérive génétique qui intervient lorsque la taille efficace de la population est faible, ce qui semble être fréquent lors de l'initiation de l'infection d'un hôte ou d'un tissu. Contrairement à la sélection, la dérive est un facteur largement aléatoire, indépendant de la valeur adaptative et peut avoir pour conséquence la fixation de mutations délétères. Malgré des taux de mutations exceptionnellement élevés, les virus à ARN semblent également répondre aux principes classiques de la génétique des populations, comme cela a été montré au cours des deux dernières décennies.