Après avoir poser les bases de ce que recouvre la notion de filière territoriales, le rapport présente tout d'abord un inventaire des filières essentiellement alimentaires en Bourgogne - Franche-Comté. Il présente ensuite les résultats d'une analyse comparative des conditions d'émergence de fonctionnement et de gouvernance de 11 études de cas et en tire des enseignements sur les principaux déterminants du développement et de la pérennisation des organisations collectives de production, transformation et commercialisation de produits alimentaires en fort développement ces dernières années. Le rapport porte une attention aux conditions d'accompagnement de ces filières par une diversité de structure de développement. Ce rapport est un livrable du projet CECAFiTer, financé par le CASDAR et visant à étudier les conditions de développement des filières territoriales en Bourgogne - Franche-Comté afin de consolider les pratiques de leur accompagnement par les acteurs du développement agricole et en particulier les Chambres d'Agriculture.