Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies - Archive ouverte HAL Access content directly
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Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies

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David Heudre
  • Function : Author
  • PersonId : 1078860
Soizic Morin

Abstract

L’Indice Biologique Diatomées (IBD), indicateur réglementaire en France pour l’évaluation de la qualité écologique des cours d’eau, prend en compte la proportion de diatomées déformées dont le profil de probabilité de présence est indicateur de stress. Pourtant, ce critère sensible dans l’IBD est insuffisamment renseigné, en particulier parce que les opérateurs sont confrontés à un problème de subjectivité dans l’attribution du caractère tératologique à une diatomée quand la déformation est subtile. Afin de documenter les tératologies les plus communes et améliorer leur prise en compte, nous mettons en place un recueil iconographique des déformations observées sur le territoire. Ce recueil, sous la forme d'une interface web collaborative, sera alimenté par les opérateurs de la surveillance afin d'acquérir une large base d'images de tératologies. Cette base de données permettra d'illustrer la diversité spécifique, ou au contraire la stabilité, des types de déformations rencontrés pour les espèces métropolitaines, et fournira ainsi une aide à la détermination du statut tératologique ou non. A plus long terme, les images collectées permettront de développer une approche d’analyse d’images automatisée pour évaluer l’intensité des déformations. Cette présentation vise à illustrer le fonctionnement de cette interface, sous forme de maquette, en présentant notamment le type de données à renseigner par les utilisateurs ainsi que la manière dont elles seront collectées. Elle a vocation à recueillir des retours et besoins utilisateurs qui serviront par la suite au développement de l'interface. Cette présentation abordera également un objectif à plus long terme au-delà de ce projet, qui est de généraliser ce type d’approche pour faciliter l’étude de la morphologie des diatomées.
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Dates and versions

hal-03791615 , version 1 (29-09-2022)

Identifiers

  • HAL Id : hal-03791615 , version 1

Cite

Iane Vallanzasca, Martin Laviale, Cyril Regan, David Heudre, Carlos E. Wetzel, et al.. Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies. 40ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2022, Clermont-Ferrand, France. ⟨hal-03791615⟩
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