<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<TEI xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:hal="http://hal.archives-ouvertes.fr/" xmlns:gml="http://www.opengis.net/gml/3.3/" xmlns:gmlce="http://www.opengis.net/gml/3.3/ce" version="1.1" xsi:schemaLocation="http://www.tei-c.org/ns/1.0 http://api.archives-ouvertes.fr/documents/aofr-sword.xsd">
  <teiHeader>
    <fileDesc>
      <titleStmt>
        <title>HAL TEI export of hal-03799759</title>
      </titleStmt>
      <publicationStmt>
        <distributor>CCSD</distributor>
        <availability status="restricted">
          <licence target="https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/">CC0 1.0 - Universal</licence>
        </availability>
        <date when="2026-05-16T02:56:52+02:00"/>
      </publicationStmt>
      <sourceDesc>
        <p part="N">HAL API Platform</p>
      </sourceDesc>
    </fileDesc>
  </teiHeader>
  <text>
    <body>
      <listBibl>
        <biblFull>
          <titleStmt>
            <title xml:lang="en">Relationship between toxicity, contamination of aquatic environments measured in caged Gammarus fossarum and disturbance of biological communities.</title>
            <title xml:lang="fr">Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques Rapport final</title>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Olivier</forename>
                <surname>Geffard</surname>
              </persName>
              <email type="md5">929d165a8289003cac26f5be7a1f8ae9</email>
              <email type="domain">inrae.fr</email>
              <idno type="idhal" notation="string">olivier-geffard</idno>
              <idno type="idhal" notation="numeric">737746</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">2186709-737746</idno>
              <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0001-7760-4644</idno>
              <idno type="VIAF">https://viaf.org/viaf/210005822</idno>
              <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/061238090</idno>
              <affiliation ref="#struct-529395"/>
            </author>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Alexandre</forename>
                <surname>Ciliberti</surname>
              </persName>
              <email type="md5">fbcfbad4ba4c527376e1f1071a500a3c</email>
              <email type="domain">unicatt.it</email>
              <idno type="idhal" notation="numeric">1019606</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">517580-1019606</idno>
            </author>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Adeline</forename>
                <surname>François</surname>
              </persName>
              <idno type="halauthorid">36294-0</idno>
              <affiliation ref="#struct-529395"/>
            </author>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Marina</forename>
                <surname>Coquery</surname>
              </persName>
              <email type="md5">1f472e095ffa437c8a781facd7acbc3b</email>
              <email type="domain">inrae.fr</email>
              <idno type="idhal" notation="string">marina-coquery</idno>
              <idno type="idhal" notation="numeric">736530</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">12363-736530</idno>
              <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0002-6831-8408</idno>
              <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/155898175</idno>
              <affiliation ref="#struct-529395"/>
            </author>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Martial</forename>
                <surname>Ferréol</surname>
              </persName>
              <idno type="halauthorid">11539-0</idno>
              <affiliation ref="#struct-529395"/>
            </author>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Arnaud</forename>
                <surname>Chaumot</surname>
              </persName>
              <email type="md5">22aff24a9ca9348fce3b883889c17c42</email>
              <email type="domain">inrae.fr</email>
              <idno type="idhal" notation="string">arnaud-chaumot</idno>
              <idno type="idhal" notation="numeric">736388</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">5635-736388</idno>
              <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0001-9132-3419</idno>
              <idno type="GOOGLE SCHOLAR">https://scholar.google.com/citations?hl=fr&amp;user=OGfPIRoAAAAJ</idno>
              <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/069962685</idno>
              <affiliation ref="#struct-529395"/>
            </author>
            <editor role="depositor">
              <persName>
                <forename>olivier</forename>
                <surname>Geffard</surname>
              </persName>
              <email type="md5">929d165a8289003cac26f5be7a1f8ae9</email>
              <email type="domain">inrae.fr</email>
            </editor>
          </titleStmt>
          <editionStmt>
            <edition n="v1" type="current">
              <date type="whenSubmitted">2022-10-06 09:41:58</date>
              <date type="whenModified">2025-08-20 03:29:59</date>
              <date type="whenReleased">2022-11-04 11:47:17</date>
              <date type="whenProduced">2018-01</date>
              <date type="whenEndEmbargoed">2022-10-06</date>
              <ref type="file" target="https://hal.inrae.fr/hal-03799759v1/document">
                <date notBefore="2022-10-06"/>
              </ref>
              <ref type="file" subtype="author" n="1" target="https://hal.inrae.fr/hal-03799759v1/file/Onema_2016-2018-fiche%2048_fin.pdf" id="file-3799759-3358360">
                <date notBefore="2022-10-06"/>
              </ref>
              <fs>
                <f name="inra_publicVise_local" notation="string" n="SC">
                  <string>Scientists</string>
                </f>
              </fs>
            </edition>
            <respStmt>
              <resp>contributor</resp>
              <name key="907213">
                <persName>
                  <forename>olivier</forename>
                  <surname>Geffard</surname>
                </persName>
                <email type="md5">929d165a8289003cac26f5be7a1f8ae9</email>
                <email type="domain">inrae.fr</email>
              </name>
            </respStmt>
          </editionStmt>
          <publicationStmt>
            <distributor>CCSD</distributor>
            <idno type="halId">hal-03799759</idno>
            <idno type="halUri">https://hal.inrae.fr/hal-03799759</idno>
            <idno type="halBibtex">geffard:hal-03799759</idno>
            <idno type="halRefHtml">[Rapport de recherche] INRAE. 2018</idno>
            <idno type="halRef">[Rapport de recherche] INRAE. 2018</idno>
            <availability status="restricted">
              <licence target="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/">CC BY 4.0 - Attribution<ref corresp="#file-3799759-3358360"/></licence>
            </availability>
          </publicationStmt>
          <seriesStmt>
            <idno type="stamp" n="SDE">Sciences De l'Environnement</idno>
            <idno type="stamp" n="IRSTEA">IRSTEA - Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (&lt;b&gt;anciennement Cemagref&lt;/b&gt;)</idno>
            <idno type="stamp" n="GIP-BE">GIP Bretagne Environnement</idno>
            <idno type="stamp" n="LARA">LARA</idno>
            <idno type="stamp" n="AGREENIUM">Archive ouverte en agrobiosciences</idno>
            <idno type="stamp" n="INRAE">Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement</idno>
            <idno type="stamp" n="RIVERLY">RIVERLY</idno>
            <idno type="stamp" n="INRAE-TRANSFERT" corresp="INRAE">Productions de transfert INRAE</idno>
          </seriesStmt>
          <notesStmt>
            <note type="report" n="6">Research Report</note>
          </notesStmt>
          <sourceDesc>
            <biblStruct>
              <analytic>
                <title xml:lang="en">Relationship between toxicity, contamination of aquatic environments measured in caged Gammarus fossarum and disturbance of biological communities.</title>
                <title xml:lang="fr">Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques Rapport final</title>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Olivier</forename>
                    <surname>Geffard</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">929d165a8289003cac26f5be7a1f8ae9</email>
                  <email type="domain">inrae.fr</email>
                  <idno type="idhal" notation="string">olivier-geffard</idno>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">737746</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">2186709-737746</idno>
                  <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0001-7760-4644</idno>
                  <idno type="VIAF">https://viaf.org/viaf/210005822</idno>
                  <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/061238090</idno>
                  <affiliation ref="#struct-529395"/>
                </author>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Alexandre</forename>
                    <surname>Ciliberti</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">fbcfbad4ba4c527376e1f1071a500a3c</email>
                  <email type="domain">unicatt.it</email>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">1019606</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">517580-1019606</idno>
                </author>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Adeline</forename>
                    <surname>François</surname>
                  </persName>
                  <idno type="halauthorid">36294-0</idno>
                  <affiliation ref="#struct-529395"/>
                </author>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Marina</forename>
                    <surname>Coquery</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">1f472e095ffa437c8a781facd7acbc3b</email>
                  <email type="domain">inrae.fr</email>
                  <idno type="idhal" notation="string">marina-coquery</idno>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">736530</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">12363-736530</idno>
                  <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0002-6831-8408</idno>
                  <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/155898175</idno>
                  <affiliation ref="#struct-529395"/>
                </author>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Martial</forename>
                    <surname>Ferréol</surname>
                  </persName>
                  <idno type="halauthorid">11539-0</idno>
                  <affiliation ref="#struct-529395"/>
                </author>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Arnaud</forename>
                    <surname>Chaumot</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">22aff24a9ca9348fce3b883889c17c42</email>
                  <email type="domain">inrae.fr</email>
                  <idno type="idhal" notation="string">arnaud-chaumot</idno>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">736388</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">5635-736388</idno>
                  <idno type="ORCID">https://orcid.org/0000-0001-9132-3419</idno>
                  <idno type="GOOGLE SCHOLAR">https://scholar.google.com/citations?hl=fr&amp;user=OGfPIRoAAAAJ</idno>
                  <idno type="IDREF">https://www.idref.fr/069962685</idno>
                  <affiliation ref="#struct-529395"/>
                </author>
              </analytic>
              <monogr>
                <imprint>
                  <date type="datePub">2018-01</date>
                </imprint>
                <authority type="institution">INRAE</authority>
              </monogr>
            </biblStruct>
          </sourceDesc>
          <profileDesc>
            <langUsage>
              <language ident="fr">French</language>
            </langUsage>
            <textClass>
              <keywords scheme="author">
                <term xml:lang="fr">Biosurveillance environnementale</term>
                <term xml:lang="fr">biosurveillance des milieux aquatique</term>
                <term xml:lang="fr">contamination biodisponible en Cd</term>
                <term xml:lang="fr">Hg</term>
                <term xml:lang="fr">Ni et Pb</term>
                <term xml:lang="fr">Gammarus fossarum</term>
              </keywords>
              <classCode scheme="halDomain" n="sde">Environmental Sciences</classCode>
              <classCode scheme="halTypology" n="REPORT">Reports</classCode>
              <classCode scheme="halOldTypology" n="REPORT">Reports</classCode>
              <classCode scheme="halTreeTypology" n="REPORT">Reports</classCode>
            </textClass>
            <abstract xml:lang="en">
              <p>Les concentrations en contaminants biodisponibles, mesurées chez des espèces d’invertébrés bio-indicatrices, ont déjà été utilisées avec succès pour établir des liens entre la pression chimique et les dégradations des communautés d’invertébrés, ceci à l’échelle d’un cours d’eau ou de petits bassins versants. Cependant, la mise en œuvre de cette approche comparative et empirique à une plus grande échelle spatiale demeure un défi en raison de la diversité des contextes biogéographiques. Au niveau national, il est d’une part difficile de trouver une espèce sentinelle répartie sur l’ensemble du territoire et d’autre part, l’impact de facteurs biotiques (état physiologique des organismes, espèces, historique d’exposition, mécanismes d’adaptation) joue un rôle important sur la concentration accumulée et donc la possibilité de comparer les systèmes hydriques étudiés. Dans nos travaux précédents, il a été montré que l’utilisation de l’encagement d’organismes calibrés et de référence permet d’utiliser un outil commun pour la biosurveillance des milieux aquatiques et à une large échelle géographique, en limitant l’influence de facteurs de confusion sur les niveaux de contamination biodisponible (concentration accumulée). Dans la présente étude, les niveaux de contamination biodisponible en Cd, Hg, Ni et Pb, évaluées par biosurveillance active avec l’amphipode Gammarus fossarum, ont été comparés à l’abondance des gammaridés natifs, sur 94 sites répartis en France. Les densités de gammares pour chaque site d’étude ont été extraites des ba’eeses de données du programme de surveillance de l’état écologique, mis en œuvre par les agences françaises de l’eau dans le cadre de la directive cadre sur l’eau. Les abondances relatives ont été déterminées, intégrant l’influence de la typologie physico-chimique des cours d’eau sur leur capacité maximale à accueillir des gammaridés, afin de pourvoir comparer les niveaux d’abondances observés sur les 94 sites étudiés. Les résultats montrent un lien clair entre la densité en gammares et les niveaux de contamination biodisponible pour trois des quatre éléments métalliques étudiés (Cd, Ni et Pb). Des concentrations seuils dans les organismes encagés au-dessus desquels la densité de gammares natifs dans le cours d’eau est anormalement faible – seuil de concentration biodisponible d’effet écologique (BEAC) - ont été déterminées. La fiabilité et la validité des BEAC, leur comparaison avec les BBAC (valeur seuil de contamination biodisponible) et leur utilité en termes de priorisation des contaminants, des sites dans la gestion des milieux aquatiques continentaux, sont discutée</p>
            </abstract>
          </profileDesc>
        </biblFull>
      </listBibl>
    </body>
    <back>
      <listOrg type="structures">
        <org type="laboratory" xml:id="struct-529395" status="OLD">
          <idno type="IdRef">257595988</idno>
          <idno type="RNSR">201822687L</idno>
          <orgName>RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes</orgName>
          <date type="start">2018-01-01</date>
          <date type="end">2019-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>5 rue de la Doua - CS 20244  F-69625 Villeurbanne cedex</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">http://www.irstea.fr</ref>
          </desc>
          <listRelation>
            <relation name="UR1469" active="#struct-302049" type="direct"/>
          </listRelation>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-302049" status="OLD">
          <idno type="ROR">https://ror.org/01wep6g48</idno>
          <orgName>Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture</orgName>
          <orgName type="acronym">IRSTEA</orgName>
          <date type="start">2012-01-01</date>
          <date type="end">2019-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">http://www.irstea.fr</ref>
          </desc>
        </org>
      </listOrg>
    </back>
  </text>
</TEI>