Dans le cadre de cette présentation, nous illustrerons l’apport de la microscopie dans l’étude des bactéries et de leurs interactions avec les cellules hôtes. Pour cela, nous nous appuierons sur des travaux réalisés au sein de l’unité STLO sur des bactéries d'intérêt alimentaire et des bactéries pathogènes. En particulier, des exemples de la caractérisation de cellule bactérienne et de certains de ses constituants lors de cultures planctoniques et en biofilms, et des interactions de ces cellules avec celles de leur hôte, par différentes approches de microscopie (confocale, fluorescence, SEM, TEM, Cryo-EM) seront présentés.