Développement d’outils en ligne pour la détection et la quantification de spores de flores bactériennes d’altération
Résumé
Le contexte
Ces dix dernières années, les préoccupations des consommateurs concernant les qualités sanitaires, nutritionnelles et organoleptiques des aliments stérilisés n'ont cessé de croître. De ce fait, les conserveurs améliorent constamment l'emballage et le procédé de fabrication de leurs produits. Ces modifications peuvent favoriser l'émergence de bactéries sporulées thermorésistantes telles que Geobacillus stearothermophilus et Moorella thermoacetica. La présence de leurs spores est responsable dans 70% des cas des altérations à 55°C des produits appertisés. Pour limiter les pertes économiques et le gaspillage alimentaire, une quantification de G. stearothermophilus peut être réalisée avant traitement thermique, mais les méthodes culturales sont longues et fastidieuses et ne permettent pas d'obtenir un résultat en moins de 3 à 5 jours.
Le projet
Le projet SPORES-QUANTUM, propose de développer des aptacapteurs dédiés à la détection en temps réel des spores de G. stearothermophilus. Ce projet vise à concevoir des outils biocapteurs en utilisant comme élément de bio-reconnaissance un aptamère d'ADN obtenu par la technologie SELEX. Les oligonucléotides sélectionnés au cours du protocole SELEX ont été séquencés par séquençage à haut débit (HTS) et des candidats potentiels pour la reconnaissance de la cible ont été retenus. Une fois triés, les aptamères obtenus seront intégrés dans des biocapteurs optiques et électrochimiques.