L'intestin est un organe complexe aux fonctions multiples. En effet, il participe à la digestion et l'absorption des nutriments et protège l'individu des agressions par des agents pathogènes intestinaux en assurant un rôle de barrière. L'étude de ce compartiment digestif reste toutefois limitée par l'accès aux tissus que ce soit chez l'Homme ou l'animal. Dans ce contexte, le développement d'organoïdes intestinaux à partir de cellules souches représente une avancée technologique importante dans l'étude de la physiopathologie intestinale. De plus, cet outil permet de répondre à une demande sociétale visant à réduire l'usage d'animaux modèles pour la recherche et s'inscrit dans la démarche des 3Rs (Remplacement, Réduction et Raffinement). L'objectif de cette revue est, à partir de rappels de la fonction digestive, de faire un état des lieux sur les différents types d'organoïdes intestinaux existants dérivés d'animaux de rente et de discuter leurs avantages, leurs limites et surtout leur application.