Mobilizing the genetic lever to fight against Taphrina deformans responsible for peach leaf curl
Mobiliser le levier génétique pour lutter contre Taphrina deformans, responsable de la cloque du pêcher
Abstract
The peach tree, Prunus persica (L.), is susceptible to numerous pathogens and pests. The use of chemical control is problematic from both an environmental and health point of view, and can lead to the emergence of resistant strains. Peach blister, a disease caused by Taphrina deformans, an ascomycete fungus, is highly problematic, as it can lead to significant losses in production and ultimately to the death of the tree if left unchecked for several years. Symptoms emerge in spring, with the appearance of reddish areas on the leaves, which thicken and become deformed. Despite the urgency of the situation, no resistant varieties are available. Only tolerant varieties have been identified, which suggests a complex genetic determinism via numerous loci or QTL with weak effects. We recorded symptoms in the orchard on 2 progenies and a diversity panel of 206 accessions to complete the multi-year series already available. These multi-year data were then analysed using genotype-phenotype linkage analysis. Several QTLs were identified on 4 populations and a marker identified as significant was detected on the panel. In addition, we adapted a laboratory fungus culture protocol and the controlled infection test on detached leaves. This enabled us to observe the development of Taphrina deformans spores and hyphae on the underside of sampled leaves. The combination of phenotype-genotype exploration and the development of the controlled infection test could make it possible to effectively mobilise genetic leverage to identify the best sources of resistance as quickly as possible and pyramid them into future varieties.
Le pêcher, Prunus persica (L.), est sensible à de nombreux agents pathogènes et ravageurs. La lutte chimique privilégiée pose problème d’un point de vue environnemental et sanitaire et peut conduire à l’émergence de souches résistantes. La cloque du pêcher, maladie causée par Taphrina deformans, un champignon ascomycète, est très problématique car elle peut provoquer des pertes notables de production et aboutir à la mort de l’arbre si elle n’est pas maîtrisée sur plusieurs années. Les symptômes émergent au printemps avec l’apparition de zones rougeâtres sur les feuilles qui s’épaississent et se déforment. Malgré l’urgence de la situation, aucune variété résistante n’est disponible. Seules des variétés tolérantes ont été identifiées, ce qui suggère un déterminisme génétique complexe par de nombreux loci ou QTL à effets faibles. Nous avons réalisé des notations des symptômes en verger sur 2 descendances et un panel de diversité composé de 206 accessions pour compléter une série pluri-annuelle déjà disponible. Ces données multi année ont ensuite été analysées par analyse de liaison génotype-phénotype. Plusieurs QTLs ont été identifiés sur 4 populations et un marqueur identifié comme significatif a été détecté sur le panel. De plus, nous avons adapté un protocole de culture de champignon en laboratoire et le test d’infection contrôlée sur feuilles détachées. Ceci a permis d’observer le développement de spores et d’hyphes de Taphrina deformans sur la face inférieure de feuilles prélevées. L’alliance de l’exploration phénotype-génotype et le développement du test d’infection contrôlée, pourrait permettre de mobiliser efficacement le levier génétique pour identifier au plus vite les meilleures sources de résistance et les pyramider dans de futures variétés.
