Allele-specific PCR: development and application to SNP genotyping in Californian thrips
PCR allèle spécifique : mise au point et application au génotypage SNP chez le thrips californien
Résumé
In this study we present a technique of ADN extraction adaptated to very small samples like the californian thrips as well as the implementation and the genotyping by allele-specific PCR of G275E of the sub-unit α6 of the nicotine receptor of the studied acetylcholine, from this pest, in the resistance to a biological insecticide : Spinosad. The double objective of this technique is to be able to genotype rapidly, economically and individually insects that are very difficult to see and to be able to create a distribution map of the G275E among French population of Frankliniella occidentalis.
Nous présentons une technique d’extraction d’ADN adaptée aux très petits échantillons tel que le thrips californien ainsi que la mise au point et le génotypage par PCR allèle spécifique de la mutation G275E de la sous unité α6 du récepteur nicotinique de l’acétylcholine impliqué, chez ce ravageur, dans la résistance à un insecticide biologique : le Spinosad. Le double objectif de cette technique est de pouvoir génotyper rapidement, économiquement et individuellement des insectes à peine visibles à l’œil nu et ce faisant, pouvoir établir la carte de distribution de la mutation G275E dans les populations françaises de Frankliniella occidentalis.
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