Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Article Dans Une Revue Nature Communications Année : 2024

Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines

Lydia Teboul (1) , James Amos-Landgraf (2) , Fernando J Benavides (3) , Marie-Christine Birling (4) , Steve D M Brown (4) , Elizabeth Bryda (5) , Rosie Bunton-Stasyshyn (1) , Hsian-Jean Chin , Martina Crispo (6) , Fabien Delerue (7) , Michael Dobbie (8) , Craig L Franklin (5) , Ernst-Martin Fuchtbauer (9) , Xiang Gao (10) , Christelle Golzio (11) , Rebecca Haffner (12) , Yann Hérault (11) , Martin Hrabe de Angelis (13) , Kevin C Kent Lloyd (14) , Terry R Magnuson (15) , Lluis Montoliu (16, 17) , Stephen A Murray (18) , Ki-Hoan Nam (19) , Lauryl M J Nutter (20) , Eric Pailhoux (21) , Fernando Pardo Manuel de Villena (15) , Kevin Peterson (18) , Laura Reinholdt (18) , Radislav Sedlacek (22) , Je Kyung Seong (23) , Toshihiko Shiroishi (24) , Cynthia Smith (18) , Toru Takeo (25) , Louise Tinsley (1) , Jean-Luc Vilotte (26) , Søren Warming (27) , Sara Wells (1, 28) , C Bruce Whitelaw (29) , Atsushi Yoshiki (24) , Chi-Kuang Wang , Jacqueline Marvel (4) , Ana Zarubica , Jason Heaney , Ian F Korf , Cathleen Lutz , Andrew J Kueh , Paul Q Thomas , Ruth M Arkell , Graham J Mann , Guillaume Pavlovic (4)
1 MRC Harwell
2 University of Missouri School of Medicine
3 The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
4 ICS - Institut Clinique de la Souris
5 Mizzou - University of Missouri [Columbia]
6 Institut Pasteur de Montevideo
7 MD Anderson Cancer Center [Houston]
8 ANU - Australian National University
9 Aarhus University [Aarhus]
10 NJU - Nanjing University
11 IGBMC - Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire
12 Weizmann Institute of Science [Rehovot, Israël]
13 TUM - Technische Universität Munchen - Technical University Munich - Université Technique de Munich
14 UC Davis - University of California [Davis]
15 UNC - University of North Carolina [Charlotte]
16 CNB-CSIC - Centro Nacional de Biotecnología [Madrid]
17 CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)
18 JAX - The Jackson Laboratory [Bar Harbor]
19 KRIBB - Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology
20 SickKids - The Hospital for sick children [Toronto]
21 BREED - Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement
22 CAS - Czech Academy of Sciences [Prague]
23 SNU - Seoul National University [Seoul]
24 RIKEN BRC - RIKEN BioResource Research Center [Tsukuba, Japan]
25 Kumamoto University
26 GABI - Génétique Animale et Biologie Intégrative
27 Genentech, Inc. [San Francisco]
28 The Francis Crick Institute [London]
29 The Roslin Institute
Lydia Teboul
Connectez-vous pour contacter l'auteur
MRC Harwell
James Amos-Landgraf
University of Missouri School of Medicine
Fernando J Benavides
The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston]
Marie-Christine Birling
Institut Clinique de la Souris
Steve D M Brown
  • Fonction : Auteur
Institut Clinique de la Souris
Elizabeth Bryda
  • Fonction : Auteur
University of Missouri [Columbia]
Rosie Bunton-Stasyshyn
MRC Harwell
Hsian-Jean Chin
Martina Crispo
Institut Pasteur de Montevideo
Fabien Delerue
MD Anderson Cancer Center [Houston]
Michael Dobbie
Australian National University
Craig L Franklin
University of Missouri [Columbia]
Ernst-Martin Fuchtbauer
Aarhus University [Aarhus]
Xiang Gao
  • Fonction : Auteur
Nanjing University
Christelle Golzio
Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire
Rebecca Haffner
Weizmann Institute of Science [Rehovot, Israël]
Yann Hérault
Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire
CV
Martin Hrabe de Angelis
Technische Universität Munchen - Technical University Munich - Université Technique de Munich
Kevin C Kent Lloyd
University of California [Davis]
Terry R Magnuson
University of North Carolina [Charlotte]
Lluis Montoliu
Centro Nacional de Biotecnología [Madrid]
CIBER de Enfermedades Raras (CIBERER)
Stephen A Murray
The Jackson Laboratory [Bar Harbor]
Ki-Hoan Nam
Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology
Lauryl M J Nutter
The Hospital for sick children [Toronto]
Eric Pailhoux
Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement
CV
Fernando Pardo Manuel de Villena
University of North Carolina [Charlotte]
Kevin Peterson
The Jackson Laboratory [Bar Harbor]
Laura Reinholdt
The Jackson Laboratory [Bar Harbor]
Radislav Sedlacek
Czech Academy of Sciences [Prague]
Je Kyung Seong
Seoul National University [Seoul]
Toshihiko Shiroishi
RIKEN BioResource Research Center [Tsukuba, Japan]
Cynthia Smith
The Jackson Laboratory [Bar Harbor]
Toru Takeo
Kumamoto University
Louise Tinsley
MRC Harwell
Jean-Luc Vilotte
Génétique Animale et Biologie Intégrative
Søren Warming
Genentech, Inc. [San Francisco]
Sara Wells
MRC Harwell
The Francis Crick Institute [London]
C Bruce Whitelaw
The Roslin Institute
Atsushi Yoshiki
RIKEN BioResource Research Center [Tsukuba, Japan]
Chi-Kuang Wang
  • Fonction : Auteur
Jacqueline Marvel
  • Fonction : Auteur
Institut Clinique de la Souris
Ana Zarubica
  • Fonction : Auteur
Jason Heaney
  • Fonction : Auteur
Ian F Korf
  • Fonction : Auteur
Cathleen Lutz
  • Fonction : Auteur
Andrew J Kueh
  • Fonction : Auteur
Paul Q Thomas
  • Fonction : Auteur
Ruth M Arkell
  • Fonction : Auteur
Graham J Mann
  • Fonction : Auteur
Guillaume Pavlovic
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Institut Clinique de la Souris

Résumé

The biomedical research community addresses reproducibility challenges in animal studies through standardized nomenclature, improved experimental design, transparent reporting, data sharing, and centralized repositories. The ARRIVE guidelines outline documentation standards for laboratory animals in experiments, but genetic information is often incomplete. To remedy this, we propose the Laboratory Animal Genetic Reporting (LAG-R) framework. LAG-R aims to document animals' genetic makeup in scientific publications, providing essential details for replication and appropriate model use. While verifying complete genetic compositions may be impractical, better reporting and validation efforts enhance reliability of research. LAG-R standardization will bolster reproducibility, peer review, and overall scientific rigor.

Domaines

Sciences du Vivant [q-bio]
Fichier principal
Vignette du fichier
41467_2024_Article_49439.pdf (2.49 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Licence
Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Partage selon les Conditions Initiales

INRAE BREED  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.inrae.fr/hal-04637964

Soumis le : lundi 8 juillet 2024-09:33:59

Dernière modification le : mardi 8 octobre 2024-18:40:36

Archivage à long terme le : jeudi 10 octobre 2024-07:58:14

Télécharger pour visualiser

Dates et versions

hal-04637964 , version 1 (08-07-2024)

Licence

Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Partage selon les Conditions Initiales

Identifiants

Citer

Lydia Teboul, James Amos-Landgraf, Fernando J Benavides, Marie-Christine Birling, Steve D M Brown, et al.. Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines. Nature Communications, 2024, 15 (5574), ⟨10.1038/s41467-024-49439-y⟩. ⟨hal-04637964⟩

Exporter

BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite

Collections

RIIP AGROPARISTECH CNRS IGBMC RIIP_MONTEVIDEO UVSQ UNIV-PARIS-SACLAY SITE-ALSACE ENVA INRAE BREED GENETIQUE_ANIMALE ANR GS-BIOSPHERA GS-LIFE-SCIENCES-HEALTH PHASE GABI SAPS
177 Consultations
23 Téléchargements

Altmetric

Partager

More