The Ruminant Telomere-to-Telomere (RT2T) Consortium
Theodore Kalbfleisch
,
Stephanie Mckay
(1)
,
Brenda Murdoch
,
David Adelson
(2)
,
Diego Almansa-Villa
,
Gabrielle Becker
,
Linda Beckett
,
María José Benítez-Galeano
,
Fernando Biase
(3)
,
Theresa Casey
,
Edward Chuong
,
Emily Clark
(4, 5, 6)
,
Shannon Clarke
,
Noelle Cockett
(7)
,
Christine Couldrey
(8)
,
Brian Davis
,
Christine Elsik
(9)
,
Thomas Faraut
(10)
,
Yahui Gao
(11, 12, 13)
,
Carine Genet
(10)
,
Patrick Grady
,
Jonathan Green
,
Richard Green
,
Dailu Guan
,
Darren Hagen
,
Gabrielle Hartley
,
Mike Heaton
,
Savannah Hoyt
,
Wen Huang
,
Erich Jarvis
,
Jenna Kalleberg
,
Hasan Khatib
,
Klaus-Peter Koepfi
,
James Koltes
,
Sergey Koren
,
Christa Kuehn
,
Tosso Leeb
,
Alexander Leonard
,
George Liu
,
Wai Yee Low
,
Hunter Mcconnell
,
Kathryn Mcrae
,
Karen Miga
,
Michelle Mousel
,
Holly Neibergs
,
Temitayo Olagunju
,
Matt Pennell
,
Bruna Petry
,
Mirjam Pewsner
,
Adam Phillippy
,
Brandon Pickett
,
Paulene Pineda
,
Tamara Potapova
,
Satyanarayana Rachagani
,
Arang Rhie
,
Monique Rijnkels
,
Annie Robic
(10)
,
Nelida Rodriguez Osorio
,
Yana Safonova
,
Gustavo Schettini
,
Robert Schnabel
,
Nagabhishek Sirpu Natesh
,
Morgan Stegemiller
,
Jessica Storer
,
Paul Stothard
,
Caleb Stull
,
Gwenola Tosser-Klopp
(10)
,
Germán Traglia
,
Christopher Tuggle
,
Curtis van Tassell
,
Corey Watson
,
Rosemarie Weikard
,
Klaus Wimmers
,
Shangqian Xie
,
Liu Yang
,
Timothy Smith
,
Rachel O’neill
,
Benjamin Rosen
1
University of Vermont [Burlington]
2 Centre for Bioinformatics
3 Institute for genomics Biology
4 Edin. - University of Edinburgh
5 The Roslin Institute
6 CTLGH - Centre for Tropical Livestock Genetics and Health [Edimburgh]
7 USU - Utah State University
8 Livestock Improvement Corporation
9 Mizzou - University of Missouri [Columbia]
10 GenPhySE - Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage
11 CAU - China Agricultural University
12 USDA - USDA Agricultural Research Service [Maricopa, AZ]
13 University of Maryland [Baltimore]
2 Centre for Bioinformatics
3 Institute for genomics Biology
4 Edin. - University of Edinburgh
5 The Roslin Institute
6 CTLGH - Centre for Tropical Livestock Genetics and Health [Edimburgh]
7 USU - Utah State University
8 Livestock Improvement Corporation
9 Mizzou - University of Missouri [Columbia]
10 GenPhySE - Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage
11 CAU - China Agricultural University
12 USDA - USDA Agricultural Research Service [Maricopa, AZ]
13 University of Maryland [Baltimore]
Theodore Kalbfleisch
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407597
- ORCID : 0000-0002-2370-8189
Stephanie Mckay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407598
- ORCID : 0000-0003-1434-3111
Brenda Murdoch
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1406290
- ORCID : 0000-0001-8675-3473
David Adelson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407599
- ORCID : 0000-0003-2404-5636
Diego Almansa-Villa
- Fonction : Auteur
Gabrielle Becker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407600
- ORCID : 0000-0002-1455-6443
Linda Beckett
- Fonction : Auteur
María José Benítez-Galeano
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407601
- ORCID : 0000-0002-6332-1632
Theresa Casey
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407602
- ORCID : 0000-0002-8835-3550
Edward Chuong
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407603
- ORCID : 0000-0002-5392-937X
Shannon Clarke
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1277593
- ORCID : 0000-0002-4615-8917
Brian Davis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1281001
- ORCID : 0000-0002-6121-135X
Christine Elsik
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407604
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Carine Genet
- Fonction : Auteur
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- IdHAL : carine-genet
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Patrick Grady
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407605
- ORCID : 0000-0003-0180-7810
Jonathan Green
- Fonction : Auteur
Richard Green
- Fonction : Auteur
Dailu Guan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1388802
- ORCID : 0000-0001-8800-3158
Darren Hagen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407606
- ORCID : 0000-0001-8295-020X
Gabrielle Hartley
- Fonction : Auteur
Mike Heaton
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1295475
- ORCID : 0000-0003-1386-1208
Savannah Hoyt
- Fonction : Auteur
Wen Huang
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407607
- ORCID : 0000-0001-6788-8364
Erich Jarvis
- Fonction : Auteur
Jenna Kalleberg
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407608
- ORCID : 0000-0003-4505-8516
Hasan Khatib
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407609
- ORCID : 0000-0003-1312-1453
Klaus-Peter Koepfi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407610
- ORCID : 0000-0001-7281-0676
James Koltes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1347870
- ORCID : 0000-0003-1897-5685
Sergey Koren
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407611
- ORCID : 0000-0002-1472-8962
Christa Kuehn
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1358880
- ORCID : 0000-0002-0216-424X
Tosso Leeb
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1180161
- ORCID : 0000-0003-0553-4880
Alexander Leonard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407612
- ORCID : 0000-0001-8425-5630
George Liu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1388817
- ORCID : 0000-0003-0192-6705
Wai Yee Low
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407613
- ORCID : 0000-0002-0749-765X
Hunter Mcconnell
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407614
- ORCID : 0009-0008-3490-9518
Kathryn Mcrae
- Fonction : Auteur
Karen Miga
- Fonction : Auteur
Michelle Mousel
- Fonction : Auteur
Holly Neibergs
- Fonction : Auteur
Temitayo Olagunju
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407615
- ORCID : 0000-0002-1497-6173
Matt Pennell
- Fonction : Auteur
Bruna Petry
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1379316
- ORCID : 0000-0001-9559-8559
Mirjam Pewsner
- Fonction : Auteur
Adam Phillippy
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407616
- ORCID : 0000-0003-2983-8934
Brandon Pickett
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407617
- ORCID : 0000-0001-8235-4440
Paulene Pineda
- Fonction : Auteur
Tamara Potapova
- Fonction : Auteur
Satyanarayana Rachagani
- Fonction : Auteur
Arang Rhie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407618
- ORCID : 0000-0002-9809-8127
Monique Rijnkels
- Fonction : Auteur
Annie Robic
- Fonction : Auteur
- PersonId : 744597
- IdHAL : annie-robic
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Nelida Rodriguez Osorio
- Fonction : Auteur
Yana Safonova
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407619
- ORCID : 0000-0002-9634-4216
Gustavo Schettini
- Fonction : Auteur
Robert Schnabel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1287258
- ORCID : 0000-0001-5018-7641
Nagabhishek Sirpu Natesh
- Fonction : Auteur
Morgan Stegemiller
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407620
- ORCID : 0000-0001-9675-3047
Jessica Storer
- Fonction : Auteur
Paul Stothard
- Fonction : Auteur
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Caleb Stull
- Fonction : Auteur
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Gwenola Tosser-Klopp
- Fonction : Auteur
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Germán Traglia
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407623
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Christopher Tuggle
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1388808
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Curtis van Tassell
- Fonction : Auteur
- PersonId : 771878
- ORCID : 0000-0002-8416-2087
Corey Watson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407624
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Rosemarie Weikard
- Fonction : Auteur
Klaus Wimmers
- Fonction : Auteur
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Shangqian Xie
- Fonction : Auteur
Liu Yang
- Fonction : Auteur
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Timothy Smith
- Fonction : Auteur
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Rachel O’neill
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1407627
- ORCID : 0000-0002-1525-6821
Benjamin Rosen
- Fonction : Auteur
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Résumé
Telomere-to-telomere (T2T) assemblies reveal new insights into the structure and function of the previously ‘invisible’ parts of the genome and allow comparative analyses of complete genomes across entire clades. We present here an open collaborative effort, termed the ‘Ruminant T2T Consortium’ (RT2T), that aims to generate complete diploid assemblies for numerous species of the Artiodactyla suborder Ruminantia to examine chromosomal evolution in the context of natural selection and domestication of species used as livestock