Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence
S. Soubeyrand
(1)
,
Arnaud Estoup
(2)
,
Astrid Cruaud
(2)
,
Sylvie Malembic-Maher
(3)
,
Christine Meynard
(2)
,
Virginie Ravigné
(4)
,
Marc Barbier
(5)
,
Benoit Barrès
(6)
,
Karine Berthier
(7)
,
Simon Boitard
(2)
,
Sylvie Dallot
(4)
,
Sabrina Gaba
(8)
,
Marie Grosdidier
(1)
,
Mourad Hannachi
(9)
,
Marie-Agnès Jacques
(10)
,
Melen Leclerc
(11)
,
Philippe Lucas
(12)
,
Davide Martinetti
(1)
,
Christophe Mougel
(11)
,
Corinne Robert
(13)
,
Alain Roques
(14)
,
Jean-Pierre Rossi
(2)
,
Frédéric Suffert
(15)
,
Pierre Abad
(16)
,
Marie-Anne Auger-Rozenberg
(14)
,
Jean-Sauveur Ay
(17)
,
Marc Bardin
(7)
,
Hélène Bernard
(18)
,
David Bohan
(19)
,
Thierry Candresse
(3)
,
Philippe Castagnone-Sereno
(16)
,
Etienne Danchin
(20)
,
Chloe E. L. Delmas
(21)
,
Pauline Ezanno
(22)
,
Frédéric Fabre
(21)
,
Benoît Facon
(2)
,
Edith Gabriel
(1)
,
Jonathan Gaudin
(7)
,
Bertrand Gauffre
(23)
,
Mathieu Gautier
(2)
,
Claire Guinat
(24)
,
Claire Lavigne
(23)
,
Olivier Lemaire
(25)
,
César Martinez
(1)
,
Lucie Michel
(1)
,
Benoît Moury
(7)
,
Kiwoong Nam
(26)
,
Claire Nédellec
(27)
,
Mylène Ogliastro
(26)
,
Julien Papaïx
(1)
,
Nicolas Parisey
(11)
,
Sylvain Poggi
(11)
,
Andrea Radici
(1)
,
Jean-Yves Rasplus
(2)
,
Xavier Reboud
(19)
,
Cecile Robin
(28)
,
Mathieu Roche
(29)
,
Adrien Rusch
(21)
,
Nicolas Sauvion
(4)
,
Jean‐Claude Streito
(2)
,
Eric Verdin
(7)
,
Anne-Sophie Walker
(15)
,
Anne Xuéreb
(2)
,
Gaël Thébaud
(4)
,
Cindy E. Morris
(7)
1
BioSP -
Biostatistique et Processus Spatiaux
2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
3 BFP - Biologie du fruit et pathologie
4 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
5 LISIS - Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
6 CASPER - CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
7 PV - Unité de Pathologie Végétale
8 CEBC - Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
9 SADAPT - Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
10 IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
11 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
12 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
13 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
14 URZF - Zoologie forestière
15 BIOGER - BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
16 ISA - Institut Sophia Agrobiotech
17 CESAER - Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
18 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
19 Agroécologie [Dijon]
20 INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
21 UMR SAVE - Santé et agroécologie du vignoble
22 BIOEPAR - Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
23 PSH - Plantes et systèmes de culture horticoles
24 IHAP - Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
25 SVQV - Santé de la vigne et qualité du vin
26 DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
27 MaIAGE - Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
28 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
29 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
2 UMR CBGP - Centre de Biologie pour la Gestion des Populations
3 BFP - Biologie du fruit et pathologie
4 UMR PHIM - Plant Health Institute of Montpellier
5 LISIS - Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés
6 CASPER - CAractérisation et Suivi des Phénomènes d'Evolution de Résistance aux pesticides
7 PV - Unité de Pathologie Végétale
8 CEBC - Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372
9 SADAPT - Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires
10 IRHS - Institut de Recherche en Horticulture et Semences
11 IGEPP - Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes
12 iEES Paris - Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris
13 ECOSYS - Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes
14 URZF - Zoologie forestière
15 BIOGER - BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture
16 ISA - Institut Sophia Agrobiotech
17 CESAER - Centre d'économie et de sociologie rurales appliquées à l'agriculture et aux espaces ruraux
18 LABERCA - Laboratoire d'étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments
19 Agroécologie [Dijon]
20 INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement
21 UMR SAVE - Santé et agroécologie du vignoble
22 BIOEPAR - Biologie, Epidémiologie et analyse de risque en Santé Animale
23 PSH - Plantes et systèmes de culture horticoles
24 IHAP - Interactions hôtes-agents pathogènes [Toulouse]
25 SVQV - Santé de la vigne et qualité du vin
26 DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes - Insectes [Montpellier]
27 MaIAGE - Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas]
28 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
29 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
S. Soubeyrand
Connectez-vous pour contacter l'auteur
- Fonction : Auteur correspondant
- PersonId : 1179451
- IdHAL : samuel-soubeyrand
- ORCID : 0000-0003-2447-3067
Connectez-vous pour contacter l'auteur
Arnaud Estoup
- Fonction : Auteur
- PersonId : 745567
- IdHAL : arnaud-estoup
- ORCID : 0000-0002-4357-6144
- IdRef : 129457035
Astrid Cruaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736960
- IdHAL : acruaud
- ORCID : 0000-0001-8932-4199
- IdRef : 253128617
Sylvie Malembic-Maher
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1206846
- IdHAL : sylvie-malembic-maher
- ORCID : 0000-0001-8422-6610
Christine Meynard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1206888
- IdHAL : cnmeynard
- ORCID : 0000-0002-5983-6289
Virginie Ravigné
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1136571
- ORCID : 0000-0002-4252-2574
- IdRef : 07925442X
Marc Barbier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1188229
- IdHAL : marc-barbier
- ORCID : 0000-0002-9868-7546
Benoit Barrès
- Fonction : Auteur
- PersonId : 784265
- IdHAL : absent-user
- ORCID : 0000-0002-6777-0275
- IdRef : 112469256
Karine Berthier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736571
- IdHAL : karine-berthier
- ORCID : 0000-0002-2260-7968
- IdRef : 107908573
Simon Boitard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736344
- IdHAL : simon-boitard
- ORCID : 0000-0002-2499-5052
- IdRef : 114957460
Sylvie Dallot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1181597
- IdHAL : sylvie-dallot
- ORCID : 0000-0003-2556-6820
Sabrina Gaba
- Fonction : Auteur
- PersonId : 183677
- IdHAL : sabrina-gaba
- ORCID : 0000-0002-7145-6713
- IdRef : 172604664
Marie Grosdidier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1397304
- IdHAL : marie-grosdidier
Mourad Hannachi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 781332
- IdHAL : mourad-hannachi
- ORCID : 0000-0002-4711-5775
Marie-Agnès Jacques
- Fonction : Auteur
- PersonId : 747798
- IdHAL : marie-agnes-jacques
- ORCID : 0000-0002-1442-917X
Melen Leclerc
- Fonction : Auteur
- PersonId : 748860
- IdHAL : melen-leclerc
- ORCID : 0000-0002-5314-461X
- IdRef : 139897658
Philippe Lucas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741083
- IdHAL : philippe-lucas
- ORCID : 0000-0003-2166-8248
- IdRef : 170280306
Davide Martinetti
- Fonction : Auteur
- PersonId : 737274
- IdHAL : davide-martinetti
- ORCID : 0000-0003-2047-1793
- IdRef : 253130808
Christophe Mougel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 740018
- IdHAL : christophe-mougel
- ORCID : 0000-0001-8675-3115
- IdRef : 118184334
Alain Roques
- Fonction : Auteur
- PersonId : 752464
- IdHAL : alain-roques
- ORCID : 0000-0002-3734-3918
- IdRef : 028253892
Jean-Pierre Rossi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736408
- IdHAL : jean-pierre-rossi
- ORCID : 0000-0002-8139-1116
- IdRef : 145510794
Frédéric Suffert
- Fonction : Auteur
- PersonId : 803070
- IdHAL : frederic-suffert
- ORCID : 0000-0001-6969-3878
Marie-Anne Auger-Rozenberg
- Fonction : Auteur
- PersonId : 743191
- IdHAL : marie-anne-auger-rozenberg
- ORCID : 0000-0002-2455-2438
- IdRef : 227256824
Jean-Sauveur Ay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 734693
- IdHAL : jean-sauveur-ay
- ORCID : 0000-0003-0679-5601
- IdRef : 243575491
Marc Bardin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 183945
- IdHAL : marc-bardin
- ORCID : 0000-0002-2803-7695
- IdRef : 139877657
Hélène Bernard
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1207444
- IdHAL : helene-bernard-moyne
David Bohan
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1157891
- IdHAL : david-bohan
- ORCID : 0000-0001-5656-775X
- IdRef : 171774051
Thierry Candresse
- Fonction : Auteur
- PersonId : 741063
- IdHAL : thierry-candresse
- ORCID : 0000-0001-9757-1835
- IdRef : 058616438
Philippe Castagnone-Sereno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736028
- IdHAL : philippe-castagnone
- ORCID : 0000-0003-2048-9651
Etienne Danchin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 734755
- IdHAL : danchin-etienne-gj
- ORCID : 0000-0003-4146-5608
- IdRef : 033644780
Chloe E. L. Delmas
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736736
- IdHAL : chloe-delmas
- ORCID : 0000-0003-3568-605X
Pauline Ezanno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 747264
- IdHAL : pauline-ezanno
- ORCID : 0000-0002-0034-8950
- IdRef : 177334991
Frédéric Fabre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735831
- IdHAL : frederic-fabre
- ORCID : 0000-0001-8271-7678
- IdRef : 083686339
Benoît Facon
- Fonction : Auteur
- PersonId : 747439
- IdHAL : benoit-facon
- ORCID : 0000-0001-8970-6840
Edith Gabriel
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736270
- IdHAL : edith-gabriel
- ORCID : 0000-0002-3712-7270
Jonathan Gaudin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 738320
- IdHAL : jonathan-gaudin
Bertrand Gauffre
- Fonction : Auteur
- PersonId : 751497
- IdHAL : bertrand-gauffre
- ORCID : 0000-0001-5431-8098
- IdRef : 132139251
Mathieu Gautier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735868
- IdHAL : mathieu-gautier-1976
- ORCID : 0000-0001-7257-5880
- IdRef : 242327257
Claire Guinat
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1212462
- IdHAL : claire-guinat
- ORCID : 0000-0002-8245-9290
Claire Lavigne
- Fonction : Auteur
- PersonId : 743451
- IdHAL : claire-lavigne
- ORCID : 0000-0003-2869-5177
- IdRef : 074779575
Olivier Lemaire
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1191623
- ORCID : 0000-0002-6042-4361
Benoît Moury
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735342
- IdHAL : benoit-moury
- ORCID : 0000-0003-3081-1034
- IdRef : 152351558
Kiwoong Nam
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1252956
- IdHAL : kiwoong-nam
- ORCID : 0000-0003-3194-8673
Claire Nédellec
- Fonction : Auteur
- PersonId : 15560
- IdHAL : claire-nedellec
- ORCID : 0000-0002-0577-0595
- IdRef : 093860749
Mylène Ogliastro
- Fonction : Auteur
- PersonId : 740527
- IdHAL : mylene-ogliastro
- ORCID : 0000-0003-4841-7043
- IdRef : 167635050
Julien Papaïx
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162935
- IdHAL : julien-papaix
- ORCID : 0000-0003-2273-5334
Nicolas Parisey
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1199398
- IdHAL : nicolas-parisey
- ORCID : 0000-0003-2439-3809
Sylvain Poggi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735729
- IdHAL : sylvain-poggi
- ORCID : 0000-0003-3051-5091
- IdRef : 129955272
Andrea Radici
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1166788
- ORCID : 0000-0001-5852-0015
Jean-Yves Rasplus
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1157669
- IdHAL : jean-yves-rasplus
- ORCID : 0000-0001-8614-6665
- IdRef : 031082343
Xavier Reboud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 9765
- IdHAL : xavier-reboud
- ORCID : 0000-0001-6430-153X
- IdRef : 131433954
Cecile Robin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 745786
- IdHAL : cecile-robin
- ORCID : 0000-0002-8145-245X
- IdRef : 163688303
Mathieu Roche
- Fonction : Auteur
- PersonId : 4967
- IdHAL : mathieu-roche
- ORCID : 0000-0003-3272-8568
- IdRef : 09042087X
Adrien Rusch
- Fonction : Auteur
- PersonId : 746318
- IdHAL : adrien-rusch
- ORCID : 0000-0002-3921-9750
- IdRef : 166478113
Nicolas Sauvion
- Fonction : Auteur
- PersonId : 169923
- IdHAL : nicolas-sauvion
- ORCID : 0000-0002-1641-5871
- IdRef : 153709804
Jean‐Claude Streito
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1137413
- ORCID : 0000-0002-9104-2657
Eric Verdin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 745108
- IdHAL : eric-verdin
- ORCID : 0000-0002-6416-1597
Anne-Sophie Walker
- Fonction : Auteur
- PersonId : 182764
- IdHAL : anne-sophie-walker
- ORCID : 0000-0002-1246-246X
- IdRef : 170703851
Anne Xuéreb
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1206655
- IdHAL : anne-xuereb
- ORCID : 0000-0003-1728-0785
Gaël Thébaud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 736217
- IdHAL : gael-thebaud
- ORCID : 0000-0002-2987-4997
- IdRef : 115671692
Cindy E. Morris
- Fonction : Auteur
- PersonId : 735447
- IdHAL : cindy-e-morris
- ORCID : 0000-0002-9135-1812
- IdRef : 174820585
Résumé
In an era marked by rapid global changes, the reinforcement and modernization of plant health surveillance systems have become imperative. Sixty-five scientists present here a research agenda for an enhanced and modernized plant health surveillance to anticipate and mitigate disease and pest emergence. Our approach integrates a wide range of scientific fields (from life, social, physical and engineering sciences) and identifies the key knowledge gaps, focusing on anticipation, risk assessment, early detection, and multi-actor collaboration. The research directions we propose are organized around four complementary thematic axes. The first axis is the anticipation of pest emergence, encompassing innovative forecasting, adaptive potential, and the effects of climatic and cropping system changes. The second axis addresses the use of versatile broad-spectrum surveillance tools, including molecular or imaging diagnostics supported by artificial intelligence, and monitoring generic matrices such as air and water. The third axis focuses on surveillance of known pests from new perspectives, i.e., using novel approaches to detect known species but also anticipating and detecting, within a species, the populations or genotypes that pose a higher risk. The fourth axis advocates the management of plant health as a commons through the establishment of multi-actor and cooperative surveillance systems for long-term data-driven alert systems and information dissemination. We stress the importance of integrating data and information from multiple sources through open science databases and metadata, alongside developing methods for interpolating and extrapolating incomplete data. Finally, we advocate an Integrated Health Surveillance approach in the One Health context, favoring tailored and versatile solutions to plant health problems and recognizing the interconnected risks to the health of plants, humans, animals and the environment, including food insecurity, pesticide residues, environmental pollution and alterations of ecosystem services.
Origine | Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte |
---|---|
Licence |