Implementing a program of host genomics of key host-pathogen systems in livestock
Abstract
I will provide an overview of relevant programs set in place, particularly on the pig system, first at Parco Tecnologico Padano (Italy, since 2001) and more recently at INRA (Unité GABI, Jouy-en-Josas, since 2011).Two viral systems are considered. The Pseudorabies virus is the aetiological agent of Aujeszky’s disease in pigs and our main model system to explore the biology of miRNAs during viral latency. The Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) participates in a variety of polymicrobial syndromes and is the most important infectious pathogen in pigs worldwide. A recent integrated INRA project aims to prepare the French swine industry to the likely emergence of new pathogenic PRRSV strains. The common item of these researches is to investigate the role and relative importance of miRNAs during pathogenesis and as biomarkers of host response, in the context of an international initiative aimed at the annotation of regulatory elements of livestock genomes.
Je donnerai un aperçu des programmes pertinents mis en place, en particulier sur le système du porc, d'abord au Parco Tecnologico Padano (Italie, depuis 2001) et plus récemment à l'INRA (Unité GABI, Jouy-en-Josas, depuis 2011). Deux systèmes viraux sont pris en compte. Le virus de la pseudorage est l'agent étiologique de la maladie d'Aujeszky chez les porcs et notre système de modèle principal pour explorer la biologie des miARN pendant la latence virale. Le virus de la Syndrome dysgénésique et respiratoire du porc (PRRSV) a un grand impact économique chez les élevages a niveau mondiale. Un projet récent vise à préparer l'industrie porcine française à l'émergence probable de nouvelles souches PRRSV. L'élément commun de ces recherches est d'étudier le rôle et importance relative des miARN dans la pathogenèse virale et comme biomarqueurs, dans le cadre d'une initiative internationale visant à l'annotation des éléments de régulation de génomes d'animaux d'élevage.