Le changement climatique (CC) influence le développement des maladies des plantes et leur répartitiongéographique. Ainsi, pour adapter l’agriculture à ces nouvelles conditions, des outils de compréhensionet de prévision du fonctionnement d'une large gamme de pathogènes sont nécessaires. Ce travail a eucomme objectif de développer un modèle générique, mécaniste et dynamique de maladies fongiquesaériennes à coupler à un modèle de fonctionnement des cultures.Une analyse bibliographique a permis d’identifier les principaux types de réponses des pathogènes auxfacteurs du système plante-climat-pathogène. Selon les processus épidémiologiques concernés, desfonctions de réponse génériques ont été identifiées ou développées. Le modèle construit, MDMA, simulel’enchaînement de monocycles épidémiques à l’échelle du cycle cultural via une structure modulaire etcalcule la dynamique de sévérité de maladie (% de surface malade).Le modèle MDMA couple au modèle STICS a été ensuite appliqué à la rouille brune (Puccinia triticina)du blé (Triticum aestivum) et au mildiou (Plasmopara viticola) de la vigne (Vitis vinifera). Sa calibrationet évaluation sur des données observées ont montré son aptitude à reproduire des dynamiques de sévéritéde ces deux pathosystèmes.Enfin, une étude d’impacts du CC sur ces deux pathosystèmes a été réalisée sur trois sites représentatifsdes grands climats français, Avignon, Bordeaux et Dijon, à partir du scénario d’émission de gaz à effetde serre A1B. Le modèle a permis de comprendre l’évolution des principales étapes de la maladie, endistinguant l’effet direct de l’effet indirect (via la plante) du climat. Ainsi, une augmentation générale desévérité de rouille brune due à l’augmentation des températures favorisant la réalisation des cyclesépidémiques hivernaux est attendue. La sévérité du mildiou tend à diminuer en raison de la baisse depluviométrie. Cette étude a mis en évidence le besoin d’une connaissance approfondie du fonctionnementdes pathosytèmes face aux nouvelles conditions climatiques attendues.