«. Dans-cette-crise, Or la recherche n'a pas su y apporter un minimum d'explications et encore moins de réponse, alors même que la science portait une lourde responsabilité dans le bouleversement de la conception du vivant. On a mis la science du côté du progrès en oubliant qu'elle était aussi synonyme d'arrachement et de transformation de notre identité, la question de la relation à la nature et au vivant, qu'il soit animal ou végétal, est pourtant essentielle

, L'expression importante à retenir dans cette citation de Bertrand Hervieu est « conception du vivant

C. , Je rejoins le haut responsable de notre institution dans sa vision de problèmes très profonds qui sont loin d'être réglés. Je soutiens aussi le constat que la science dominante est associée à une conception particulière du vivant. Je ne parlerais pas de modification mais de création d'une conception nouvelle conférant une nature uniquement matérielle aux organismes vivants, justifiant toutes biotechnologies. Cette conception prend difficilement en compte toutes les dimensions relationnelles, les différences de conception faussent les discussions sur les méthodes à retenir pour relever les défis agricoles à venir

, Elle cherchera préférentiellement des solutions dans l'environnement de la plante et non seulement dans la plante elle-même. Selon une conception du vivant ou une autre, la stratégie sera complètement différente voire opposée. L'émergence d'un nouveau paradigme revendiquée par de nombreux auteurs sousentend le retour au sensible, qualité propre au vivant, et de redevenir capable d'une relation avec la nature qui nous entoure. Les paysans-sélectionneurs parlent parfois de la sélection de leurs populations comme d'un compagnonnage : « Parce que moi, Prenons un exemple : la notion de santé chez les plantes. La science dominante a conçu le terme de bio-agresseurs pour désigner l'origine des maladies sur une culture considérée, 2009.

, Ma position m'oblige à faire référence à un système de pensée tout en sachant qu'il faut en préparer un autre qui, petit à petit, rejoindra celui des paysans qui fonctionnent entièrement dans cet autre. J'ai expérimenté plusieurs formes de recherche (recherche fondamentale, recherche-action, recherche participative) et pour terminer par quelque chose qui se rapproche d'une recherche-ingéniérique. Les trois premières formes positionnent le chercheur par rapport aux destinataires de sa recherche, on cherche à exprimer dans la dernière, la recherche-ingéniérique, Ma place de chercheur investie en recherche participative pour les agriculture biologique et paysanne dans une institution publique, a été parfois délicate à gérer au quotidien

, Je rappellerai les objectifs que la direction de l'INRA nous a donné pour les dix ans à venir. Ils sont déjà mon quotidien depuis 10 ans

, Inra pour cela ?doit évoluer. Evoluer, avec quelques objectifs forts pour les dix ans à venir. Dix ans pour devenir un acteur de la recherche internationale

, Dix ans pour progresser en agro-écologie et sur les approches prédictives en biologie

, Dix ans pour co-construire avec les acteurs, professionnels comme associatifs ou territoriaux, des trajectoires d'innovation appropriables, durables et performantes

, Dix ans pour anticiper et contribuer à l'expertise publique en matière d'alimentation, d'environnement et d'agriculture

, Dix ans pour accompagner les innovations en travaillant leurs impacts sur les pratiques professionnelles et la société

, Je terminerai par une anecdote. Je me suis présentée au concours d' « ingénieur Hors-classe, 2010.

D. Jeu, Véronique, on est chercheur militant ? » Ce à quoi j'ai répondu : « pour développer des projets sur la biodiversité cultivée, l'agriculture biologique, la recherche participative au début des années 2000, il a bien fallu forcer quelques portes ». Finalement, est-ce du militantisme ou tout simplement, la passion du métier ? Références Ahn WS (2011) Korean native species collection plus their diffusion and exchange in the private sector-Preconference on seeds, le président de jury regarde mon dossier, lève les yeux et déclare : « Alors

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, Cette modification phénotypique est potentiellement réversible, suggérant l'implication de mécanismes épigénétiques. L'objectif de la thèse est d'identifier un ensemble de gènes susceptibles d'être impliqués dans le phénomène de l'aberration. Deux approches ont été développées : sans a priori, en recherchant des fragments différentiellement exprimés ou méthylés par AFLP-ADNc et MSAP, et avec a priori, en analysant l'expression de gènes impliqués dans les mécanismes épigénétiques et dans la morphologie foliaire. Ces analyses ont permis d'identifier 25 séquences présentant une homologie avec des gènes connus. L'identification des gènes Bowax9A-E a retenu notre attention étant donné qu'ils appartiennent à la famille des LTPs, impliquée dans le transport de composés cuticulaires, dans les réponses aux stress, et dans les mécanismes de résistance systémique induite. Le polymorphisme de méthylation a été analysé afin de comparer son amplitude au sein de l'espèce et entre choux normaux et aberrants d'une même variété. Le taux de méthylation MSAP de B. oleracea (52-60 %) est supérieur à ce qui a été rapporté chez d'autres espèces, Les classifications phénétiques des populations et lignées sont apparues être différentes en fonction des polymorphismes générés par MSAP ou AFLP. Aucun marqueur de méthylation différentielle des génomes « normaux

, L'étude approfondie des conséquences phénotypiques au niveau cuticulaire et des voies de régulation impliquées dans la morphologie foliaire (de type miRNA) devrait permettre à terme d'identifier les voies de régulation du caractère aberrant et d'

, Chez les Brassicaceae, l'AI est sous le contrôle d'un locus-S complexe et polyallélique avec au moins trois gènes liés qui co-ségrégent avec le phénotype auto-incompatible. Ce système de reconnaissance est associé à des variations quantitatives de la force de rejet du pollen incompatible. Dans ce travail, nous avons analysé la variabilité de la réaction d'AI dans un contexte diploïde chez Brassica oleracea et dans un contexte polyploïde chez Brassica napus. Chez B. oleracea, nous avons montré l'existence d'une variation phénotypique considérable aussi bien dans une situation génétique hétérogène que dans une situation consanguine. Le niveau de l'AI varie de l'AI stricte à l'autofertilité. L'analyse moléculaire a montré que l'autocompatibilité partielle (ACP) est liée à la, Résumé L'auto-incompatibilité (AI) joue un rôle clé dans la diversité génétique et l'évolution des espèces car elle favorise la pollinisation croisée en rejetant l'autopollen

, Chez le colza (B. napus, génome AACC, 2n = 4x = 38), espèce allopolyploïde issue d'hybridation spontanée entre le chou (B. oleracea, CC, 2n = 2x = 18) et la navette (B. rapa, AA, 2n = 2x = 20), les parents diploïdes sont généralement auto-incompatibles tandis que le colza est autocompatible. Dans cette étude, nous avons tenté d'élucider les conséquences de la polyploïdie sur ce système complexe en analysant l'expression de l'AI chez plusieurs colzas synthétiques. Les résultats ont montré que l'effet de la polyploïdie sur le phénotype de l'AI est variable selon les progéniteurs et leur composition allélique. Le phénotypes d'AI est plus ou moins modifiée suivant les générations. Par ailleurs, nous avons montré que le locus S subit quelques modifications structurales suite à la polyploidisation. En S0, le locus S des deux génomes parentaux A et C est présent chez toutes les plantes, tandis qu'en S3, il y a perte du locus S du génome parental A chez quelques plantes. L'analyse de l'expression des gènes parentaux chez tous les hybrides (S0 et S3), montre une expression différentielle de SRK et SCR selon les plantes. Ce matériel constitue un modèle de choix pour identifier de nouveaux mécanismes qui pourraient contribuer d'une part à élucider l'étendue de la plasticité, Une réduction significative de l'expression du gène SRK chez les fleurs âgées caractérise les plantes à ACP par rapport aux plantes auto-incompatibles

, Mots clés : Brassica oleracea, Brassica napus, auto-incompatibilité, polyploïdie, locus-S

, We analyzed the variability of the SI response in diploid Brassica oleracea and in polyploid Brassica napus. In B. oleracea, we found a continuous phenotypic variation for SI response in plants with heterogeneous and plants with homogenous genetic backgrounds, from the strict SI reaction to self-compatibility. Molecular analysis revealed that partial self-compatibility (PSC) was associated with decreased SRK or SCR/SP11 expression. A significant reduction of the SRK gene expression in old flowers characterizes the PSC plants, resulting in reduction of the SI phenotype during the life of the flower. In rapeseed (B. napus, genome AACC, 2n = 4x = 38), an allotetraploid species produced after a spontaneous hybridization between B. oleracea (CC, 2n = 2x = 18) and B. rapa (AA, 2n = 2x = 20), diploid parents have generally a self-incompatibility system while B. napus is self-compatible. In this study, we investigated the consequences of polyploidy on the SI complex system by analyzing the phenotypes and the S-products in several synthetic rapeseeds. The results showed that the effect of polyploidy on the phenotype of self-incompatibility was variable depending on the progenitors and their allelic composition and they showed variable modifications following generations. Furthermore, structural or functional changes at the S locus were observed following the polyploidization. While S0 plants inherited the S loci of both parental genomes A and C, some S3 plants lost the S locus of the A parental genome. The analysis of the expression of SLG and SRK parental genes in all hybrids (S0 and S3) showed a differential expression of these genes among plants. The plants described in this study, Brassicaceae, SI is under the control of a complex multiallelic S-locus which contains at least three genes that cosegregate with the SI phenotype. This recognition system is associated with quantitative variation of the strength of the SI reaction

, Key words: Brassica oleracea, Brassica napus, self-incompatibility, polyploidy, S-locus, S 15 haplotype Les deux espèces ont été choisies comme modèle car elle représentent des situations contrastées, pour la sélection comme pour l'approche qualitative, pour le produit analysé (produit transformé/produit frais), le type de culture

, Au cours de la thèse, nous aborderons deux modèles qui correspondent à deux phases d'un programme de sélection, à la fois dans une démarche de sélection participative et de celle d'un sélectionneur professionnel, partenaire de SOLIBAM. Dans le premier modèle, nous suivrons les paramètres de la qualité dès les premiers étapes de la sélection quand des plantes de différentes groupes sont combinées pour constituer un pool de base, en étudiant le cas de la sélection de brocoli à jets (connus pour sa qualité gustative mais inadapté aux techniques actuelles de production des agriculteurs). Dans le second, les populations ont déjà subi un ou deux cycles de sélection pour des qualités agronomiques et phénotypiques, il s'agira d'apporter des méthodes pour maintenir les qualités sélectionnées au cours de l'amélioration des populations et/ou pour la sélection de lignées

, Des tests consommateurs impliquant également les acteurs aval de la filière (préparateurs) seront mis en place pour valider la correspondance des nouvelles variétés avec leurs attentes. Une équipe de recherche de l'ESA d'Angers, GRAPPE, assurera l'encadrement scientifique dans le domaine de l'analyse sensorielle. Les données sensorielles seront croisées avec des données des données physico-chimiques (spectrométrie infra-rouge, pénétrométrie?) pour assurer la validité, Des « Focus Group » permettront d'identifier les attentes des consommateurs et des préparateurs sur les marchés concernés et d'établir ainsi

. Enfin, des corrélations entre mesures instrumentales et mesures sensorielles seront recherchées afin de faciliter la compréhension des facteurs à privilégier pour améliorer la qualité et la communication sur la qualité des produits, Les données agronomiques et génétiques acquises dans le programme SOLIBAM sur les mêmes populations seront confrontées aux données organoleptiques pour faire émerger les stratégies d'amélioration de la qualité

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