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Thèse

Analyse de la séquence génomique et étude de l’adaptation à l’acidité de Lactobacillus. delbrueckii ssp. bulgaricus ATCC11842

Résumé : Le travail décrit dans cette thèse a commencé à un moment où peu de données génétiques sur Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus (L. bulgaricus) étaient disponibles. Le séquençage du génome de la souche ATCC 11842, en collaboration avec le Génoscope, était en cours. La première partie de cette thèse décrit le travail effectué sur l’annotation et l’analyse du génome. Cette dernière suggère que L. bulgaricus est en voie de spécialisation à une niche écologique restreinte, le milieu lait. Elle révèle également que L. bulgaricus possède peu de systèmes de régulation et de résistance aux stress environnementaux. Ces résultats nous ont conduit à faire l’hypothèse que L. bulgaricus serait un bon modèle pour identifier les mécanismes essentiels pour l’adaptation à l’acidité (ATR). La deuxième partie de la thèse décrit les études menées sur l’ATR de L. bulgaricus par différentes approches complémentaires. Les résultats transcriptomiques mettent en évidence que l'expression de 20% des régulateurs ainsi que celle de 50% des transporteurs d’ions de L. bulgaricus est modifiée par l’ATR. En revanche, aucun des 5 facteurs σ ni des 5 systèmes à deux composants du génome ne présente une expression variable. L’analyse protéomique par électrophorèse bidimensionnelle révèle 19 protéines dont l’abondance est affectée par l’ATR, parmi lesquelles les protéines chaperons et des protéines impliquées dans la biosynthèse des acides gras. L'ensemble des résultats suggère que l’ATR de L. bulgaricus fait intervenir de multiples régulateurs, des phénomènes d’atténuation de la transcription, et des régulations posttranscriptionnelles et post-traductionnelles. Ces résultats préliminaires nécessitent cependant des analyses complémentaires pour déterminer quelle partie des réponses visualisées est réellement à la base de la résistance accrue à l'acidité acquise après adaptation.
Type de document :
Thèse
Liste complète des métadonnées

https://hal.inrae.fr/tel-02820708
Déposant : Migration Prodinra <>
Soumis le : samedi 6 juin 2020 - 18:22:13
Dernière modification le : vendredi 12 juin 2020 - 10:43:26

Identifiants

  • HAL Id : tel-02820708, version 1
  • PRODINRA : 306123

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Citation

Stéphanie Penaud. Analyse de la séquence génomique et étude de l’adaptation à l’acidité de Lactobacillus. delbrueckii ssp. bulgaricus ATCC11842. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris 11, 2006. Français. ⟨tel-02820708⟩

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