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Thèse

Effet de la mycorhization sur la structure génétique et fonctionnelle des communautés bactériennes dans la rhizosphère de Medicago truncatula

Résumé : Les communautés bactériennes associées à (i) M. Truncatula J5 (Myc+/Nod+) et TRV48 (Myc+/Nod-) et à (ii) M. Truncatula TRV25 (Myc-/Nod-) ont été comparées. La structure génétique des communautés a été caractérisée par une empreinte moléculaire A-RISA. Les structures génétiques des communautés associées aux racines mycorhizées et non-mycorhizées étaient significativement différentes. Des bactéries appartenant aux Oxalobacteraceae et aux Comamonadaceae étaient préférentiellement associées aux racines mycorhizées. La diversité génétique des bactéries cultivables appartenant à ces groupes a été analysée par BOX-PCR. La diversité des isolats issus des racines mycorhizées et non-mycorhizées était significativement différente. La structure fonctionnelle des communautés a été caractérisée par une approche protéomique. Des protéines impliquées dans la stabilisation structurelle étaient significativement plus fréquentes dans le métaprotéome des communautés associées aux racines mycorhizées suggérant que les bactéries colonisant les racines mycorhizées subissent un stress plus élevé que celles colonisant les racines non-mycorhizées.
Type de document :
Thèse
Liste complète des métadonnées

https://hal.inrae.fr/tel-02822793
Déposant : Migration Prodinra <>
Soumis le : samedi 6 juin 2020 - 20:47:04
Dernière modification le : vendredi 12 juin 2020 - 10:43:26

Identifiants

  • HAL Id : tel-02822793, version 1
  • PRODINRA : 39353

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Pierre Offre. Effet de la mycorhization sur la structure génétique et fonctionnelle des communautés bactériennes dans la rhizosphère de Medicago truncatula. Sciences du Vivant [q-bio]. Université de Bourgogne; Ecole Doctorale Buffon, 2007. Français. ⟨tel-02822793⟩

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