Evaluation du potentiel de variabilité du Potato leafroll virus (Luteoviridae, Polerovirus) et identification de quelques facteurs de sélection - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2003

Evaluation du potentiel de variabilité du Potato leafroll virus (Luteoviridae, Polerovirus) et identification de quelques facteurs de sélection

Résumé

Le Potato leafroll virus(PLRV, famille des Luteoviridae) est l'un des plus dommageables sur culture de pomme de terre à l'échelle mondiale. Ce virus est potentiellement très variable de par la nature de son génome (ARN), ce qui lui confère un potentiel d'adaptation élevé. Cependant, des travaux basés sur un faible jeu de données indiquent que la diversité génétique du PLRV est très restreinte. Afin de mettre en place des stratégies de lutte génétique durables contre ce virus, il est important d'en estimer le potentiel évolutif réel. Au cours de ce travail, la diversité génétique du virus a été étudiée par l'analyse de nouvelles séquences complètes et d'une région variable du génome du virus. Les résultats confirment que le PLRV est peu diversifié et génétiquement stable dans l'espace et dans le temps, même si des évènements majeurs (délétion, recombinaison et accroissement de zone codante) ont ponctué l'histoire évolutive du virus. Des passages en série réalisés par vecteurs ou par multiplication végétative sur plantes entières et sur cals ont identifié la transmission comme pression de sélection et comme facteur pouvant favoriser la dérive génétique et la fixation de mutations délétères, et montré que le PLRV peut varier davantage en cas de changement d'environnement. Le PLRV semble donc optimisé dans un milieu stable et homogène, mais il pourrait exprimer son potentiel évolutif lorsque les pressions de sélection changent.
Fichier non déposé

Dates et versions

tel-02833024 , version 1 (07-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : tel-02833024 , version 1
  • PRODINRA : 22233

Citer

Sébastien Guyader. Evaluation du potentiel de variabilité du Potato leafroll virus (Luteoviridae, Polerovirus) et identification de quelques facteurs de sélection. Sciences du Vivant [q-bio]. Ecole Doctorale Vie-Agro-Santé; Université de Rennes 1, 2003. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02833024⟩
13 Consultations
0 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More