Après une présentation de la mesure de l'efficacité dans un contexte paramétrique et non paramétrique, cette thèse développe les outils méthodologiques permettant une mesure non paramétrique de l'efficacité technique et allocative que ce soit dans un contexte primal ou dual. Elle montre l'influence des quasi-fixités de facteurs sur la mesure de l'efficacité technique. De même, la prise en compte de contraintes réglementaires peut s'interpréter en termes de fixités factorielles. Ces notions sont appliquées à la production céréalière et à la production porcine pour mesurer les réductions potentielles d'intrants polluants si l'on arrivait à résorber l'inefficacité technique des producteurs.