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Inférence de réseaux de régulation de gènes au travers de scores étendus dans les réseaux bayésiens

Résumé : L’inférence de réseaux de régulation de gènes s’oriente actuellement vers l’utilisation conjointe d’informations biologiques complémentaires. Nous utilisons ici des données de marqueurs génétiques en plus des classiques données d’expression dans le cadre des réseaux bayésiens statiques discrets. Nous comparons les qualités de différents scores ainsi que l’impact d’un a priori lié à la connectivité des réseaux. Nous proposons et comparons deux modélisations aux approches existantes pour l’inférence de réseaux de régulation. Sur des données simulées, l’un de nos modèles obtient les meilleurs résultats dans le cas d’échantillons de petites tailles. Nous utilisons ce même modèle sur des données réelles d’Arabidopsis thaliana.
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https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01197611
Déposant : Archive Ouverte Prodinra <>
Soumis le : vendredi 11 septembre 2015 - 20:09:30
Dernière modification le : lundi 21 septembre 2020 - 19:32:01

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Citation

Jimmy Vandel, Brigitte Mangin, Matthieu Vignes, Damien Leroux, Olivier Loudet, et al.. Inférence de réseaux de régulation de gènes au travers de scores étendus dans les réseaux bayésiens. Revue des Sciences et Technologies de l'Information - Série RIA : Revue d'Intelligence Artificielle, Lavoisier, 2012, 26 (6), pp.679-708. ⟨10.3166/ria.26.679-708⟩. ⟨hal-01197611⟩

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