InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nucleic Acids Research Année : 2012

InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database

Sarah Hunter
  • Fonction : Auteur correspondant
Philip Jones
  • Fonction : Auteur correspondant
Alex Mitchell
  • Fonction : Auteur correspondant
Edouard de Castro
  • Fonction : Auteur
CMU
Nicolas Hulo
  • Fonction : Auteur
CMU
Daniel Kahn
Elizabeth Kelly
  • Fonction : Auteur
Nicola Mulder
Catherine Rivoire
  • Fonction : Auteur
CMU
Christian J. A. Sigrist
  • Fonction : Auteur
CMU

Résumé

InterPro (http://www.ebi.ac.uk/interpro/) is a database that integrates diverse information about protein families, domains and functional sites, and makes it freely available to the public via Web-based interfaces and services. Central to the database are diagnostic models, known as signatures, against which protein sequences can be searched to determine their potential function. InterPro has utility in the large-scale analysis of whole genomes and meta-genomes, as well as in characterizing individual protein sequences. Herein we give an overview of new developments in the database and its associated software since 2009, including updates to database content, curation processes and Web and programmatic interfaces.
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2012_Hunter_Nucleic Acids Research_1.pdf (2.92 Mo) Télécharger le fichier
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Dates et versions

hal-02652188 , version 1 (29-05-2020)

Identifiants

Citer

Sarah Hunter, Philip Jones, Alex Mitchell, Rolf Apweiler, Teresa K. Attwood, et al.. InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database. Nucleic Acids Research, 2012, 40 (D1), pp.D306-D312. ⟨10.1093/nar/gkr948⟩. ⟨hal-02652188⟩
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