Un premier pas vers la compréhension des données biologiques.
Résumé
Although the quality of soils has to be managed, knowledge about soil functioning remains incomplete particularly because the biological components at the center of the whole transformation process of the organic matter remains to be described. The objective of this essay is to demonstrate the interest of a multi-parameter approach in order to utilise the micro-organisms as indicators of the state of soils. Cellular, molecular and membrane markers of the microbial communities (bacteria and fungi) have been proposed in order to determine the abundance of these organisms under different natural (climate, soil status) and anthropogenic (grassland, cultivated land) constraints. The measurement of these structural markers was completed by measuring the enzymatic activities with the aim of understanding the eventual links between structure and function. Multiway analysis of variance (ANOVA) has allowed the quantification of the impact of environmental factors studied on the measured markers. Coupled with correlation analysis between the different markers, this work proposes elements for reflection concerning the choice of pertinent indicators of the state of the soil.
S’il est indispensable de maîtriser la qualité des sols, les connaissances sur son fonctionnement demeurent lacunaires, notamment parce que la composante biologique à l’origine de l’ensemble des processus de transformation de la matière organique reste à décrire. Dans cet essai, l’objectif est de montrer l’intérêt d’une approche multiparamétrique pour envisager d’utiliser les microorganismes comme indicateurs de l’état des sols. Des marqueurs cellulaires, moléculaires et membranaires des communautés microbiennes (bactéries et champignons) ont été proposés afin de déterminer les abondances de ces organismes sous différentes contraintes naturelles (incluant le climat, le cycle cultural…) et anthropiques (prairie / grande culture). La mesure de ces marqueurs structurels a été complétée par la mesure des activités enzymatiques dans l’objectif d’appréhender d’éventuels liens entre structure et fonction. Des analyses de la variance à plusieurs facteurs ont permis de quantifier l’impact des facteurs environnementaux étudiés sur les marqueurs mesurés. Couplé aux analyses des corrélations entre les différents marqueurs, ce travail permet de proposer des éléments de réflexion pour le choix d’indicateurs pertinents de l’état des sols.
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)